Protein–RNA interactions for Protein: Q60687

Fshb, Follitropin subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FshbQ60687 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FshbQ60687 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FshbQ60687 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FshbQ60687 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FshbQ60687 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FshbQ60687 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FshbQ60687 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FshbQ60687 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FshbQ60687 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
FshbQ60687 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
FshbQ60687 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FshbQ60687 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FshbQ60687 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FshbQ60687 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FshbQ60687 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
FshbQ60687 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FshbQ60687 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FshbQ60687 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FshbQ60687 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FshbQ60687 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FshbQ60687 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FshbQ60687 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FshbQ60687 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FshbQ60687 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FshbQ60687 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FshbQ60687 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FshbQ60687 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FshbQ60687 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FshbQ60687 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FshbQ60687 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FshbQ60687 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FshbQ60687 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FshbQ60687 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FshbQ60687 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FshbQ60687 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FshbQ60687 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FshbQ60687 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FshbQ60687 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
FshbQ60687 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FshbQ60687 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FshbQ60687 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FshbQ60687 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FshbQ60687 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FshbQ60687 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FshbQ60687 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FshbQ60687 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FshbQ60687 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FshbQ60687 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FshbQ60687 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FshbQ60687 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FshbQ60687 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FshbQ60687 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FshbQ60687 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FshbQ60687 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
FshbQ60687 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FshbQ60687 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FshbQ60687 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FshbQ60687 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FshbQ60687 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FshbQ60687 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FshbQ60687 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FshbQ60687 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FshbQ60687 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
FshbQ60687 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FshbQ60687 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FshbQ60687 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FshbQ60687 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FshbQ60687 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FshbQ60687 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FshbQ60687 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FshbQ60687 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FshbQ60687 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FshbQ60687 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FshbQ60687 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FshbQ60687 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
FshbQ60687 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FshbQ60687 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FshbQ60687 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FshbQ60687 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FshbQ60687 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
FshbQ60687 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FshbQ60687 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FshbQ60687 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FshbQ60687 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FshbQ60687 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FshbQ60687 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FshbQ60687 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FshbQ60687 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FshbQ60687 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FshbQ60687 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FshbQ60687 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
FshbQ60687 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FshbQ60687 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FshbQ60687 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FshbQ60687 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FshbQ60687 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FshbQ60687 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FshbQ60687 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FshbQ60687 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
FshbQ60687 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms