Protein–RNA interactions for Protein: Q60662

Akap4, A-kinase anchor protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 849 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Akap4Q60662 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Akap4Q60662 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Akap4Q60662 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Akap4Q60662 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Akap4Q60662 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Akap4Q60662 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Akap4Q60662 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Akap4Q60662 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Akap4Q60662 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Akap4Q60662 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Akap4Q60662 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Akap4Q60662 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Akap4Q60662 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Akap4Q60662 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Akap4Q60662 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Akap4Q60662 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Akap4Q60662 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Akap4Q60662 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Akap4Q60662 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Akap4Q60662 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Akap4Q60662 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Akap4Q60662 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Akap4Q60662 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Akap4Q60662 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Akap4Q60662 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Akap4Q60662 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Akap4Q60662 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Akap4Q60662 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Akap4Q60662 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Akap4Q60662 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Akap4Q60662 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Akap4Q60662 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Akap4Q60662 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Akap4Q60662 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Akap4Q60662 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Akap4Q60662 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Akap4Q60662 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Akap4Q60662 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Akap4Q60662 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Akap4Q60662 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Akap4Q60662 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Akap4Q60662 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Akap4Q60662 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Akap4Q60662 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Akap4Q60662 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Akap4Q60662 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Akap4Q60662 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Akap4Q60662 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Akap4Q60662 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Akap4Q60662 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Akap4Q60662 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Akap4Q60662 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Akap4Q60662 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Akap4Q60662 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Akap4Q60662 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Akap4Q60662 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Akap4Q60662 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Akap4Q60662 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Akap4Q60662 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Akap4Q60662 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Akap4Q60662 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Akap4Q60662 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Akap4Q60662 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Akap4Q60662 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Akap4Q60662 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Akap4Q60662 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Akap4Q60662 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Akap4Q60662 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Akap4Q60662 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Akap4Q60662 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Akap4Q60662 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Akap4Q60662 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Akap4Q60662 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Akap4Q60662 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Akap4Q60662 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Akap4Q60662 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Akap4Q60662 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Akap4Q60662 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Akap4Q60662 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Akap4Q60662 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Akap4Q60662 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Akap4Q60662 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Akap4Q60662 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Akap4Q60662 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Akap4Q60662 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Akap4Q60662 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Akap4Q60662 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Akap4Q60662 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Akap4Q60662 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Akap4Q60662 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Akap4Q60662 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Akap4Q60662 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Akap4Q60662 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Akap4Q60662 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Akap4Q60662 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Akap4Q60662 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Akap4Q60662 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Akap4Q60662 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Akap4Q60662 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Akap4Q60662 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms