Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prdm1Q60636 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prdm1Q60636 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prdm1Q60636 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prdm1Q60636 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prdm1Q60636 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prdm1Q60636 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prdm1Q60636 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prdm1Q60636 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prdm1Q60636 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prdm1Q60636 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prdm1Q60636 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prdm1Q60636 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Prdm1Q60636 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prdm1Q60636 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prdm1Q60636 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prdm1Q60636 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prdm1Q60636 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prdm1Q60636 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prdm1Q60636 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prdm1Q60636 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prdm1Q60636 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prdm1Q60636 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prdm1Q60636 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prdm1Q60636 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prdm1Q60636 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prdm1Q60636 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prdm1Q60636 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prdm1Q60636 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prdm1Q60636 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Prdm1Q60636 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prdm1Q60636 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prdm1Q60636 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prdm1Q60636 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prdm1Q60636 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prdm1Q60636 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prdm1Q60636 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prdm1Q60636 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prdm1Q60636 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Prdm1Q60636 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Prdm1Q60636 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Prdm1Q60636 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prdm1Q60636 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prdm1Q60636 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prdm1Q60636 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prdm1Q60636 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prdm1Q60636 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prdm1Q60636 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prdm1Q60636 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prdm1Q60636 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prdm1Q60636 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prdm1Q60636 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prdm1Q60636 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prdm1Q60636 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prdm1Q60636 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prdm1Q60636 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prdm1Q60636 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Prdm1Q60636 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prdm1Q60636 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prdm1Q60636 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prdm1Q60636 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prdm1Q60636 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prdm1Q60636 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prdm1Q60636 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prdm1Q60636 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prdm1Q60636 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prdm1Q60636 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prdm1Q60636 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prdm1Q60636 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prdm1Q60636 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prdm1Q60636 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prdm1Q60636 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prdm1Q60636 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prdm1Q60636 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prdm1Q60636 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prdm1Q60636 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Prdm1Q60636 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prdm1Q60636 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prdm1Q60636 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prdm1Q60636 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prdm1Q60636 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Prdm1Q60636 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prdm1Q60636 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prdm1Q60636 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Prdm1Q60636 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prdm1Q60636 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prdm1Q60636 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prdm1Q60636 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prdm1Q60636 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prdm1Q60636 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prdm1Q60636 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prdm1Q60636 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prdm1Q60636 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prdm1Q60636 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Prdm1Q60636 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prdm1Q60636 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prdm1Q60636 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prdm1Q60636 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prdm1Q60636 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prdm1Q60636 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms