Protein–RNA interactions for Protein: Q52KR2

Lrig2, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig2Q52KR2 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrig2Q52KR2 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrig2Q52KR2 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrig2Q52KR2 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrig2Q52KR2 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrig2Q52KR2 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrig2Q52KR2 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrig2Q52KR2 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lrig2Q52KR2 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lrig2Q52KR2 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Lrig2Q52KR2 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Lrig2Q52KR2 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lrig2Q52KR2 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lrig2Q52KR2 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lrig2Q52KR2 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lrig2Q52KR2 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lrig2Q52KR2 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lrig2Q52KR2 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lrig2Q52KR2 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Lrig2Q52KR2 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lrig2Q52KR2 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lrig2Q52KR2 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lrig2Q52KR2 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lrig2Q52KR2 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lrig2Q52KR2 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lrig2Q52KR2 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lrig2Q52KR2 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lrig2Q52KR2 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lrig2Q52KR2 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lrig2Q52KR2 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lrig2Q52KR2 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lrig2Q52KR2 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lrig2Q52KR2 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lrig2Q52KR2 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lrig2Q52KR2 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lrig2Q52KR2 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lrig2Q52KR2 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lrig2Q52KR2 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lrig2Q52KR2 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lrig2Q52KR2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lrig2Q52KR2 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lrig2Q52KR2 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lrig2Q52KR2 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lrig2Q52KR2 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Lrig2Q52KR2 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lrig2Q52KR2 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lrig2Q52KR2 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lrig2Q52KR2 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lrig2Q52KR2 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Lrig2Q52KR2 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Lrig2Q52KR2 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Lrig2Q52KR2 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lrig2Q52KR2 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lrig2Q52KR2 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lrig2Q52KR2 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lrig2Q52KR2 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lrig2Q52KR2 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lrig2Q52KR2 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lrig2Q52KR2 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lrig2Q52KR2 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lrig2Q52KR2 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lrig2Q52KR2 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lrig2Q52KR2 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lrig2Q52KR2 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lrig2Q52KR2 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lrig2Q52KR2 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lrig2Q52KR2 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lrig2Q52KR2 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lrig2Q52KR2 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lrig2Q52KR2 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lrig2Q52KR2 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lrig2Q52KR2 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lrig2Q52KR2 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lrig2Q52KR2 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lrig2Q52KR2 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lrig2Q52KR2 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lrig2Q52KR2 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lrig2Q52KR2 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lrig2Q52KR2 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lrig2Q52KR2 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lrig2Q52KR2 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Lrig2Q52KR2 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Lrig2Q52KR2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lrig2Q52KR2 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lrig2Q52KR2 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lrig2Q52KR2 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lrig2Q52KR2 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lrig2Q52KR2 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lrig2Q52KR2 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lrig2Q52KR2 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lrig2Q52KR2 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lrig2Q52KR2 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lrig2Q52KR2 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lrig2Q52KR2 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lrig2Q52KR2 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lrig2Q52KR2 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lrig2Q52KR2 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lrig2Q52KR2 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lrig2Q52KR2 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lrig2Q52KR2 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms