Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL13

Gm527, Uncharacterized protein C14orf28 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm527Q4KL13 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm527Q4KL13 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm527Q4KL13 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm527Q4KL13 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm527Q4KL13 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm527Q4KL13 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm527Q4KL13 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm527Q4KL13 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm527Q4KL13 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm527Q4KL13 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm527Q4KL13 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm527Q4KL13 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm527Q4KL13 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm527Q4KL13 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm527Q4KL13 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm527Q4KL13 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm527Q4KL13 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm527Q4KL13 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm527Q4KL13 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm527Q4KL13 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm527Q4KL13 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm527Q4KL13 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm527Q4KL13 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm527Q4KL13 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm527Q4KL13 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm527Q4KL13 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm527Q4KL13 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm527Q4KL13 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm527Q4KL13 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm527Q4KL13 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm527Q4KL13 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm527Q4KL13 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm527Q4KL13 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm527Q4KL13 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm527Q4KL13 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm527Q4KL13 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm527Q4KL13 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm527Q4KL13 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm527Q4KL13 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm527Q4KL13 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm527Q4KL13 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm527Q4KL13 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm527Q4KL13 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm527Q4KL13 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm527Q4KL13 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm527Q4KL13 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm527Q4KL13 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm527Q4KL13 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm527Q4KL13 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm527Q4KL13 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm527Q4KL13 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm527Q4KL13 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm527Q4KL13 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm527Q4KL13 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Gm527Q4KL13 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm527Q4KL13 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm527Q4KL13 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm527Q4KL13 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm527Q4KL13 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm527Q4KL13 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm527Q4KL13 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm527Q4KL13 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm527Q4KL13 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm527Q4KL13 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm527Q4KL13 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm527Q4KL13 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm527Q4KL13 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm527Q4KL13 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm527Q4KL13 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm527Q4KL13 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm527Q4KL13 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm527Q4KL13 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm527Q4KL13 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm527Q4KL13 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm527Q4KL13 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm527Q4KL13 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm527Q4KL13 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm527Q4KL13 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm527Q4KL13 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm527Q4KL13 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm527Q4KL13 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm527Q4KL13 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm527Q4KL13 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm527Q4KL13 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm527Q4KL13 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm527Q4KL13 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm527Q4KL13 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm527Q4KL13 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm527Q4KL13 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm527Q4KL13 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm527Q4KL13 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm527Q4KL13 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm527Q4KL13 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm527Q4KL13 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm527Q4KL13 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm527Q4KL13 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm527Q4KL13 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm527Q4KL13 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm527Q4KL13 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm527Q4KL13 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
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