Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0G7

Garnl3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Garnl3Q3V0G7 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Garnl3Q3V0G7 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Garnl3Q3V0G7 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Garnl3Q3V0G7 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Garnl3Q3V0G7 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Garnl3Q3V0G7 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Garnl3Q3V0G7 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Garnl3Q3V0G7 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Garnl3Q3V0G7 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Garnl3Q3V0G7 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Garnl3Q3V0G7 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Garnl3Q3V0G7 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Garnl3Q3V0G7 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Garnl3Q3V0G7 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Garnl3Q3V0G7 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Garnl3Q3V0G7 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Garnl3Q3V0G7 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Garnl3Q3V0G7 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Garnl3Q3V0G7 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Garnl3Q3V0G7 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Garnl3Q3V0G7 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Garnl3Q3V0G7 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Garnl3Q3V0G7 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Garnl3Q3V0G7 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Garnl3Q3V0G7 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Garnl3Q3V0G7 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Garnl3Q3V0G7 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Garnl3Q3V0G7 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Garnl3Q3V0G7 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Garnl3Q3V0G7 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Garnl3Q3V0G7 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Garnl3Q3V0G7 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Garnl3Q3V0G7 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Garnl3Q3V0G7 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Garnl3Q3V0G7 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Garnl3Q3V0G7 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Garnl3Q3V0G7 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Garnl3Q3V0G7 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Garnl3Q3V0G7 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Garnl3Q3V0G7 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Garnl3Q3V0G7 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Garnl3Q3V0G7 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Garnl3Q3V0G7 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Garnl3Q3V0G7 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Garnl3Q3V0G7 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Garnl3Q3V0G7 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Garnl3Q3V0G7 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Garnl3Q3V0G7 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Garnl3Q3V0G7 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Garnl3Q3V0G7 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Garnl3Q3V0G7 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Garnl3Q3V0G7 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Garnl3Q3V0G7 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Garnl3Q3V0G7 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Garnl3Q3V0G7 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Garnl3Q3V0G7 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Garnl3Q3V0G7 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Garnl3Q3V0G7 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Garnl3Q3V0G7 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Garnl3Q3V0G7 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Garnl3Q3V0G7 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Garnl3Q3V0G7 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Garnl3Q3V0G7 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Garnl3Q3V0G7 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Garnl3Q3V0G7 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Garnl3Q3V0G7 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Garnl3Q3V0G7 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Garnl3Q3V0G7 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Garnl3Q3V0G7 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Garnl3Q3V0G7 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Garnl3Q3V0G7 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Garnl3Q3V0G7 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Garnl3Q3V0G7 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Garnl3Q3V0G7 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Garnl3Q3V0G7 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Garnl3Q3V0G7 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Garnl3Q3V0G7 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Garnl3Q3V0G7 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Garnl3Q3V0G7 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Garnl3Q3V0G7 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Garnl3Q3V0G7 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Garnl3Q3V0G7 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Garnl3Q3V0G7 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Garnl3Q3V0G7 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Garnl3Q3V0G7 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Garnl3Q3V0G7 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Garnl3Q3V0G7 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Garnl3Q3V0G7 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Garnl3Q3V0G7 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Garnl3Q3V0G7 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Garnl3Q3V0G7 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Garnl3Q3V0G7 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Garnl3Q3V0G7 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Garnl3Q3V0G7 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Garnl3Q3V0G7 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Garnl3Q3V0G7 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Garnl3Q3V0G7 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Garnl3Q3V0G7 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Garnl3Q3V0G7 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Garnl3Q3V0G7 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms