Protein–RNA interactions for Protein: Q3V089

Rbm44, RNA-binding protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 1,013 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm44Q3V089 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rbm44Q3V089 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rbm44Q3V089 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rbm44Q3V089 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Rbm44Q3V089 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rbm44Q3V089 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rbm44Q3V089 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Rbm44Q3V089 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rbm44Q3V089 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rbm44Q3V089 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rbm44Q3V089 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rbm44Q3V089 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rbm44Q3V089 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rbm44Q3V089 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rbm44Q3V089 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rbm44Q3V089 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rbm44Q3V089 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rbm44Q3V089 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rbm44Q3V089 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Rbm44Q3V089 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rbm44Q3V089 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Rbm44Q3V089 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rbm44Q3V089 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rbm44Q3V089 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rbm44Q3V089 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rbm44Q3V089 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rbm44Q3V089 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rbm44Q3V089 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rbm44Q3V089 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rbm44Q3V089 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rbm44Q3V089 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rbm44Q3V089 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rbm44Q3V089 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rbm44Q3V089 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rbm44Q3V089 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rbm44Q3V089 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rbm44Q3V089 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rbm44Q3V089 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Rbm44Q3V089 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rbm44Q3V089 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rbm44Q3V089 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rbm44Q3V089 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rbm44Q3V089 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rbm44Q3V089 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rbm44Q3V089 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rbm44Q3V089 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rbm44Q3V089 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rbm44Q3V089 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rbm44Q3V089 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Rbm44Q3V089 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rbm44Q3V089 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rbm44Q3V089 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rbm44Q3V089 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rbm44Q3V089 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rbm44Q3V089 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Rbm44Q3V089 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rbm44Q3V089 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rbm44Q3V089 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbm44Q3V089 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbm44Q3V089 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbm44Q3V089 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbm44Q3V089 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbm44Q3V089 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbm44Q3V089 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbm44Q3V089 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbm44Q3V089 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
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Rbm44Q3V089 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbm44Q3V089 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbm44Q3V089 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbm44Q3V089 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbm44Q3V089 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbm44Q3V089 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbm44Q3V089 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbm44Q3V089 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbm44Q3V089 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rbm44Q3V089 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rbm44Q3V089 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rbm44Q3V089 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rbm44Q3V089 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rbm44Q3V089 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rbm44Q3V089 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rbm44Q3V089 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rbm44Q3V089 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rbm44Q3V089 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rbm44Q3V089 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Rbm44Q3V089 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rbm44Q3V089 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rbm44Q3V089 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rbm44Q3V089 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rbm44Q3V089 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rbm44Q3V089 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rbm44Q3V089 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rbm44Q3V089 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rbm44Q3V089 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rbm44Q3V089 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rbm44Q3V089 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rbm44Q3V089 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rbm44Q3V089 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rbm44Q3V089 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
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