Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFT3

Garem1, GRB2-associated and regulator of MAPK protein, mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Garem1Q3UFT3 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Garem1Q3UFT3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Garem1Q3UFT3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Garem1Q3UFT3 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Garem1Q3UFT3 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Garem1Q3UFT3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Garem1Q3UFT3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Garem1Q3UFT3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Garem1Q3UFT3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Garem1Q3UFT3 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Garem1Q3UFT3 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Garem1Q3UFT3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Garem1Q3UFT3 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Garem1Q3UFT3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Garem1Q3UFT3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Garem1Q3UFT3 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Garem1Q3UFT3 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Garem1Q3UFT3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Garem1Q3UFT3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Garem1Q3UFT3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Garem1Q3UFT3 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Garem1Q3UFT3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Garem1Q3UFT3 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Garem1Q3UFT3 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Garem1Q3UFT3 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Garem1Q3UFT3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Garem1Q3UFT3 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Garem1Q3UFT3 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Garem1Q3UFT3 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Garem1Q3UFT3 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Garem1Q3UFT3 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Garem1Q3UFT3 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Garem1Q3UFT3 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Garem1Q3UFT3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Garem1Q3UFT3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Garem1Q3UFT3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Garem1Q3UFT3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Garem1Q3UFT3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Garem1Q3UFT3 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Garem1Q3UFT3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Garem1Q3UFT3 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Garem1Q3UFT3 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Garem1Q3UFT3 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Garem1Q3UFT3 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Garem1Q3UFT3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Garem1Q3UFT3 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Garem1Q3UFT3 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Garem1Q3UFT3 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Garem1Q3UFT3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Garem1Q3UFT3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Garem1Q3UFT3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Garem1Q3UFT3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Garem1Q3UFT3 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Garem1Q3UFT3 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Garem1Q3UFT3 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Garem1Q3UFT3 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Garem1Q3UFT3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Garem1Q3UFT3 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Garem1Q3UFT3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Garem1Q3UFT3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Garem1Q3UFT3 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Garem1Q3UFT3 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Garem1Q3UFT3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Garem1Q3UFT3 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Garem1Q3UFT3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Garem1Q3UFT3 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Garem1Q3UFT3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Garem1Q3UFT3 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Garem1Q3UFT3 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Garem1Q3UFT3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Garem1Q3UFT3 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Garem1Q3UFT3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Garem1Q3UFT3 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Garem1Q3UFT3 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Garem1Q3UFT3 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Garem1Q3UFT3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Garem1Q3UFT3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Garem1Q3UFT3 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Garem1Q3UFT3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Garem1Q3UFT3 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Garem1Q3UFT3 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Garem1Q3UFT3 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Garem1Q3UFT3 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Garem1Q3UFT3 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Garem1Q3UFT3 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Garem1Q3UFT3 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Garem1Q3UFT3 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Garem1Q3UFT3 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Garem1Q3UFT3 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Garem1Q3UFT3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Garem1Q3UFT3 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Garem1Q3UFT3 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Garem1Q3UFT3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Garem1Q3UFT3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Garem1Q3UFT3 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Garem1Q3UFT3 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Garem1Q3UFT3 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Garem1Q3UFT3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Garem1Q3UFT3 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Garem1Q3UFT3 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms