Protein–RNA interactions for Protein: Q3U7U4

Transmembrane protein C1orf162 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U7U4 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q3U7U4 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q3U7U4 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q3U7U4 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q3U7U4 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q3U7U4 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q3U7U4 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q3U7U4 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q3U7U4 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q3U7U4 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q3U7U4 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q3U7U4 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q3U7U4 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q3U7U4 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q3U7U4 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q3U7U4 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q3U7U4 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q3U7U4 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q3U7U4 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q3U7U4 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q3U7U4 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q3U7U4 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q3U7U4 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q3U7U4 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q3U7U4 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q3U7U4 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q3U7U4 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q3U7U4 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q3U7U4 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q3U7U4 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q3U7U4 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Q3U7U4 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q3U7U4 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q3U7U4 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Q3U7U4 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q3U7U4 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q3U7U4 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q3U7U4 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q3U7U4 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q3U7U4 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q3U7U4 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q3U7U4 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q3U7U4 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q3U7U4 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q3U7U4 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q3U7U4 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q3U7U4 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q3U7U4 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q3U7U4 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q3U7U4 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q3U7U4 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q3U7U4 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q3U7U4 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q3U7U4 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q3U7U4 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q3U7U4 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q3U7U4 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q3U7U4 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q3U7U4 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q3U7U4 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q3U7U4 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Q3U7U4 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q3U7U4 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q3U7U4 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q3U7U4 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q3U7U4 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q3U7U4 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q3U7U4 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q3U7U4 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q3U7U4 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q3U7U4 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q3U7U4 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q3U7U4 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q3U7U4 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q3U7U4 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q3U7U4 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q3U7U4 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q3U7U4 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q3U7U4 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q3U7U4 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q3U7U4 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q3U7U4 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q3U7U4 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q3U7U4 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q3U7U4 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q3U7U4 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q3U7U4 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q3U7U4 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q3U7U4 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q3U7U4 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q3U7U4 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q3U7U4 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q3U7U4 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q3U7U4 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q3U7U4 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q3U7U4 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q3U7U4 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q3U7U4 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q3U7U4 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q3U7U4 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms