Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3R4

Lmf1, Lipase maturation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmf1Q3U3R4 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lmf1Q3U3R4 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lmf1Q3U3R4 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lmf1Q3U3R4 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lmf1Q3U3R4 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lmf1Q3U3R4 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lmf1Q3U3R4 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lmf1Q3U3R4 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lmf1Q3U3R4 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lmf1Q3U3R4 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lmf1Q3U3R4 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lmf1Q3U3R4 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lmf1Q3U3R4 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lmf1Q3U3R4 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lmf1Q3U3R4 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lmf1Q3U3R4 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lmf1Q3U3R4 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lmf1Q3U3R4 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Lmf1Q3U3R4 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lmf1Q3U3R4 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lmf1Q3U3R4 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lmf1Q3U3R4 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lmf1Q3U3R4 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lmf1Q3U3R4 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lmf1Q3U3R4 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lmf1Q3U3R4 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lmf1Q3U3R4 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lmf1Q3U3R4 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lmf1Q3U3R4 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lmf1Q3U3R4 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lmf1Q3U3R4 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lmf1Q3U3R4 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lmf1Q3U3R4 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lmf1Q3U3R4 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lmf1Q3U3R4 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lmf1Q3U3R4 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lmf1Q3U3R4 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lmf1Q3U3R4 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lmf1Q3U3R4 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lmf1Q3U3R4 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lmf1Q3U3R4 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lmf1Q3U3R4 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lmf1Q3U3R4 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lmf1Q3U3R4 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lmf1Q3U3R4 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lmf1Q3U3R4 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lmf1Q3U3R4 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lmf1Q3U3R4 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lmf1Q3U3R4 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lmf1Q3U3R4 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lmf1Q3U3R4 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lmf1Q3U3R4 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lmf1Q3U3R4 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lmf1Q3U3R4 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lmf1Q3U3R4 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lmf1Q3U3R4 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lmf1Q3U3R4 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lmf1Q3U3R4 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lmf1Q3U3R4 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lmf1Q3U3R4 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lmf1Q3U3R4 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lmf1Q3U3R4 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lmf1Q3U3R4 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lmf1Q3U3R4 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lmf1Q3U3R4 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lmf1Q3U3R4 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lmf1Q3U3R4 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lmf1Q3U3R4 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lmf1Q3U3R4 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lmf1Q3U3R4 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lmf1Q3U3R4 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lmf1Q3U3R4 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lmf1Q3U3R4 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lmf1Q3U3R4 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Lmf1Q3U3R4 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lmf1Q3U3R4 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lmf1Q3U3R4 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lmf1Q3U3R4 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lmf1Q3U3R4 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Lmf1Q3U3R4 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lmf1Q3U3R4 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lmf1Q3U3R4 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lmf1Q3U3R4 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lmf1Q3U3R4 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lmf1Q3U3R4 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lmf1Q3U3R4 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lmf1Q3U3R4 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lmf1Q3U3R4 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lmf1Q3U3R4 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lmf1Q3U3R4 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lmf1Q3U3R4 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lmf1Q3U3R4 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lmf1Q3U3R4 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lmf1Q3U3R4 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lmf1Q3U3R4 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Lmf1Q3U3R4 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Lmf1Q3U3R4 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lmf1Q3U3R4 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lmf1Q3U3R4 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lmf1Q3U3R4 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms