Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S8

Hvcn1, Voltage-gated hydrogen channel 1, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hvcn1Q3U2S8 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
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Hvcn1Q3U2S8 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hvcn1Q3U2S8 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
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Hvcn1Q3U2S8 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hvcn1Q3U2S8 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hvcn1Q3U2S8 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Hvcn1Q3U2S8 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hvcn1Q3U2S8 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hvcn1Q3U2S8 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hvcn1Q3U2S8 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hvcn1Q3U2S8 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hvcn1Q3U2S8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hvcn1Q3U2S8 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Hvcn1Q3U2S8 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hvcn1Q3U2S8 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hvcn1Q3U2S8 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hvcn1Q3U2S8 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hvcn1Q3U2S8 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hvcn1Q3U2S8 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hvcn1Q3U2S8 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hvcn1Q3U2S8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hvcn1Q3U2S8 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hvcn1Q3U2S8 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hvcn1Q3U2S8 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hvcn1Q3U2S8 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hvcn1Q3U2S8 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hvcn1Q3U2S8 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hvcn1Q3U2S8 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hvcn1Q3U2S8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hvcn1Q3U2S8 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
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Hvcn1Q3U2S8 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hvcn1Q3U2S8 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hvcn1Q3U2S8 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hvcn1Q3U2S8 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hvcn1Q3U2S8 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
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Hvcn1Q3U2S8 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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Hvcn1Q3U2S8 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
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Hvcn1Q3U2S8 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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Hvcn1Q3U2S8 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hvcn1Q3U2S8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hvcn1Q3U2S8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hvcn1Q3U2S8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
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Hvcn1Q3U2S8 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hvcn1Q3U2S8 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hvcn1Q3U2S8 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hvcn1Q3U2S8 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hvcn1Q3U2S8 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
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Hvcn1Q3U2S8 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hvcn1Q3U2S8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hvcn1Q3U2S8 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hvcn1Q3U2S8 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hvcn1Q3U2S8 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hvcn1Q3U2S8 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hvcn1Q3U2S8 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hvcn1Q3U2S8 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hvcn1Q3U2S8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hvcn1Q3U2S8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hvcn1Q3U2S8 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Hvcn1Q3U2S8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hvcn1Q3U2S8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hvcn1Q3U2S8 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hvcn1Q3U2S8 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hvcn1Q3U2S8 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hvcn1Q3U2S8 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hvcn1Q3U2S8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hvcn1Q3U2S8 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hvcn1Q3U2S8 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hvcn1Q3U2S8 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Hvcn1Q3U2S8 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hvcn1Q3U2S8 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hvcn1Q3U2S8 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hvcn1Q3U2S8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hvcn1Q3U2S8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hvcn1Q3U2S8 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hvcn1Q3U2S8 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms