Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K0

Fam193b, Protein FAM193B, mousemouse

Predictions only

Length 892 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam193bQ3U2K0 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fam193bQ3U2K0 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fam193bQ3U2K0 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fam193bQ3U2K0 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fam193bQ3U2K0 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Fam193bQ3U2K0 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fam193bQ3U2K0 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fam193bQ3U2K0 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Fam193bQ3U2K0 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fam193bQ3U2K0 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fam193bQ3U2K0 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fam193bQ3U2K0 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fam193bQ3U2K0 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fam193bQ3U2K0 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fam193bQ3U2K0 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fam193bQ3U2K0 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fam193bQ3U2K0 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fam193bQ3U2K0 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fam193bQ3U2K0 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Fam193bQ3U2K0 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fam193bQ3U2K0 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fam193bQ3U2K0 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fam193bQ3U2K0 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fam193bQ3U2K0 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fam193bQ3U2K0 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fam193bQ3U2K0 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fam193bQ3U2K0 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fam193bQ3U2K0 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fam193bQ3U2K0 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fam193bQ3U2K0 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fam193bQ3U2K0 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fam193bQ3U2K0 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fam193bQ3U2K0 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fam193bQ3U2K0 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fam193bQ3U2K0 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fam193bQ3U2K0 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam193bQ3U2K0 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam193bQ3U2K0 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam193bQ3U2K0 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam193bQ3U2K0 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam193bQ3U2K0 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam193bQ3U2K0 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam193bQ3U2K0 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam193bQ3U2K0 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam193bQ3U2K0 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam193bQ3U2K0 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam193bQ3U2K0 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam193bQ3U2K0 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam193bQ3U2K0 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam193bQ3U2K0 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam193bQ3U2K0 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam193bQ3U2K0 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam193bQ3U2K0 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam193bQ3U2K0 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam193bQ3U2K0 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam193bQ3U2K0 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam193bQ3U2K0 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam193bQ3U2K0 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam193bQ3U2K0 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam193bQ3U2K0 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam193bQ3U2K0 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam193bQ3U2K0 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fam193bQ3U2K0 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fam193bQ3U2K0 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fam193bQ3U2K0 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fam193bQ3U2K0 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Fam193bQ3U2K0 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fam193bQ3U2K0 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Fam193bQ3U2K0 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fam193bQ3U2K0 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fam193bQ3U2K0 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fam193bQ3U2K0 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fam193bQ3U2K0 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fam193bQ3U2K0 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fam193bQ3U2K0 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fam193bQ3U2K0 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Fam193bQ3U2K0 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fam193bQ3U2K0 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fam193bQ3U2K0 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Fam193bQ3U2K0 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Fam193bQ3U2K0 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Fam193bQ3U2K0 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Fam193bQ3U2K0 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Fam193bQ3U2K0 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Fam193bQ3U2K0 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam193bQ3U2K0 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam193bQ3U2K0 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam193bQ3U2K0 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam193bQ3U2K0 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam193bQ3U2K0 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam193bQ3U2K0 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam193bQ3U2K0 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam193bQ3U2K0 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam193bQ3U2K0 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam193bQ3U2K0 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam193bQ3U2K0 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam193bQ3U2K0 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam193bQ3U2K0 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam193bQ3U2K0 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fam193bQ3U2K0 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 120.6 ms