Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVA9

Ccdc136, Coiled-coil domain-containing protein 136, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc136Q3TVA9 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Ccdc136Q3TVA9 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Ccdc136Q3TVA9 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Ccdc136Q3TVA9 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Ccdc136Q3TVA9 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
Ccdc136Q3TVA9 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Ccdc136Q3TVA9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
Ccdc136Q3TVA9 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Ccdc136Q3TVA9 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Ccdc136Q3TVA9 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Ccdc136Q3TVA9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Ccdc136Q3TVA9 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Ccdc136Q3TVA9 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Ccdc136Q3TVA9 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Ccdc136Q3TVA9 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Ccdc136Q3TVA9 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Ccdc136Q3TVA9 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Ccdc136Q3TVA9 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Ccdc136Q3TVA9 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Ccdc136Q3TVA9 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Ccdc136Q3TVA9 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Ccdc136Q3TVA9 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Ccdc136Q3TVA9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Ccdc136Q3TVA9 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Ccdc136Q3TVA9 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Ccdc136Q3TVA9 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Ccdc136Q3TVA9 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Ccdc136Q3TVA9 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Ccdc136Q3TVA9 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Ccdc136Q3TVA9 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Ccdc136Q3TVA9 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Ccdc136Q3TVA9 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Ccdc136Q3TVA9 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Ccdc136Q3TVA9 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Ccdc136Q3TVA9 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Ccdc136Q3TVA9 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Ccdc136Q3TVA9 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
Ccdc136Q3TVA9 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Ccdc136Q3TVA9 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Ccdc136Q3TVA9 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
Ccdc136Q3TVA9 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Ccdc136Q3TVA9 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Ccdc136Q3TVA9 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Ccdc136Q3TVA9 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Ccdc136Q3TVA9 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Ccdc136Q3TVA9 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Ccdc136Q3TVA9 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Ccdc136Q3TVA9 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Ccdc136Q3TVA9 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Ccdc136Q3TVA9 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Ccdc136Q3TVA9 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Ccdc136Q3TVA9 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Ccdc136Q3TVA9 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Ccdc136Q3TVA9 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Ccdc136Q3TVA9 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Ccdc136Q3TVA9 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Ccdc136Q3TVA9 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Ccdc136Q3TVA9 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Ccdc136Q3TVA9 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Ccdc136Q3TVA9 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Ccdc136Q3TVA9 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Ccdc136Q3TVA9 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Ccdc136Q3TVA9 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Ccdc136Q3TVA9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Ccdc136Q3TVA9 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
Ccdc136Q3TVA9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Ccdc136Q3TVA9 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Ccdc136Q3TVA9 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Ccdc136Q3TVA9 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Ccdc136Q3TVA9 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Ccdc136Q3TVA9 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Ccdc136Q3TVA9 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Ccdc136Q3TVA9 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
Ccdc136Q3TVA9 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Ccdc136Q3TVA9 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Ccdc136Q3TVA9 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Ccdc136Q3TVA9 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Ccdc136Q3TVA9 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Ccdc136Q3TVA9 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Ccdc136Q3TVA9 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Ccdc136Q3TVA9 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Ccdc136Q3TVA9 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Ccdc136Q3TVA9 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Ccdc136Q3TVA9 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Ccdc136Q3TVA9 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Ccdc136Q3TVA9 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Ccdc136Q3TVA9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Ccdc136Q3TVA9 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
Ccdc136Q3TVA9 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Ccdc136Q3TVA9 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Ccdc136Q3TVA9 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Ccdc136Q3TVA9 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Ccdc136Q3TVA9 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Ccdc136Q3TVA9 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Ccdc136Q3TVA9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Ccdc136Q3TVA9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Ccdc136Q3TVA9 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Ccdc136Q3TVA9 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Ccdc136Q3TVA9 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
Ccdc136Q3TVA9 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms