Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTY5

Krt2, Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt2Q3TTY5 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt2Q3TTY5 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt2Q3TTY5 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt2Q3TTY5 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt2Q3TTY5 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt2Q3TTY5 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt2Q3TTY5 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt2Q3TTY5 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt2Q3TTY5 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt2Q3TTY5 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt2Q3TTY5 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt2Q3TTY5 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt2Q3TTY5 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt2Q3TTY5 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt2Q3TTY5 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt2Q3TTY5 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt2Q3TTY5 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt2Q3TTY5 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt2Q3TTY5 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt2Q3TTY5 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt2Q3TTY5 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt2Q3TTY5 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt2Q3TTY5 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt2Q3TTY5 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt2Q3TTY5 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt2Q3TTY5 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt2Q3TTY5 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt2Q3TTY5 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt2Q3TTY5 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt2Q3TTY5 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt2Q3TTY5 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt2Q3TTY5 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt2Q3TTY5 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt2Q3TTY5 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt2Q3TTY5 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt2Q3TTY5 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt2Q3TTY5 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt2Q3TTY5 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt2Q3TTY5 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt2Q3TTY5 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt2Q3TTY5 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt2Q3TTY5 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt2Q3TTY5 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt2Q3TTY5 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt2Q3TTY5 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt2Q3TTY5 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt2Q3TTY5 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt2Q3TTY5 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt2Q3TTY5 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt2Q3TTY5 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt2Q3TTY5 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt2Q3TTY5 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt2Q3TTY5 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt2Q3TTY5 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt2Q3TTY5 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt2Q3TTY5 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Krt2Q3TTY5 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Krt2Q3TTY5 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Krt2Q3TTY5 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Krt2Q3TTY5 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt2Q3TTY5 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt2Q3TTY5 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt2Q3TTY5 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt2Q3TTY5 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt2Q3TTY5 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt2Q3TTY5 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt2Q3TTY5 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt2Q3TTY5 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt2Q3TTY5 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt2Q3TTY5 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt2Q3TTY5 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt2Q3TTY5 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt2Q3TTY5 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt2Q3TTY5 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt2Q3TTY5 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt2Q3TTY5 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt2Q3TTY5 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt2Q3TTY5 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt2Q3TTY5 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt2Q3TTY5 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt2Q3TTY5 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt2Q3TTY5 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt2Q3TTY5 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt2Q3TTY5 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt2Q3TTY5 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt2Q3TTY5 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt2Q3TTY5 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt2Q3TTY5 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt2Q3TTY5 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt2Q3TTY5 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt2Q3TTY5 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt2Q3TTY5 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt2Q3TTY5 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt2Q3TTY5 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt2Q3TTY5 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt2Q3TTY5 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt2Q3TTY5 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt2Q3TTY5 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt2Q3TTY5 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt2Q3TTY5 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms