Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc13Q3TIR1 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trappc13Q3TIR1 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trappc13Q3TIR1 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trappc13Q3TIR1 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trappc13Q3TIR1 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trappc13Q3TIR1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trappc13Q3TIR1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trappc13Q3TIR1 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trappc13Q3TIR1 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Trappc13Q3TIR1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trappc13Q3TIR1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trappc13Q3TIR1 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Trappc13Q3TIR1 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trappc13Q3TIR1 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trappc13Q3TIR1 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trappc13Q3TIR1 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trappc13Q3TIR1 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trappc13Q3TIR1 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trappc13Q3TIR1 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trappc13Q3TIR1 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trappc13Q3TIR1 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trappc13Q3TIR1 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trappc13Q3TIR1 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trappc13Q3TIR1 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trappc13Q3TIR1 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trappc13Q3TIR1 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trappc13Q3TIR1 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trappc13Q3TIR1 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trappc13Q3TIR1 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trappc13Q3TIR1 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trappc13Q3TIR1 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trappc13Q3TIR1 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trappc13Q3TIR1 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trappc13Q3TIR1 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trappc13Q3TIR1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trappc13Q3TIR1 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Trappc13Q3TIR1 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trappc13Q3TIR1 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trappc13Q3TIR1 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trappc13Q3TIR1 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trappc13Q3TIR1 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Trappc13Q3TIR1 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trappc13Q3TIR1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trappc13Q3TIR1 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Trappc13Q3TIR1 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trappc13Q3TIR1 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trappc13Q3TIR1 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trappc13Q3TIR1 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trappc13Q3TIR1 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trappc13Q3TIR1 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trappc13Q3TIR1 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trappc13Q3TIR1 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trappc13Q3TIR1 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trappc13Q3TIR1 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trappc13Q3TIR1 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trappc13Q3TIR1 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trappc13Q3TIR1 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trappc13Q3TIR1 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Trappc13Q3TIR1 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trappc13Q3TIR1 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trappc13Q3TIR1 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trappc13Q3TIR1 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trappc13Q3TIR1 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trappc13Q3TIR1 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trappc13Q3TIR1 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trappc13Q3TIR1 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trappc13Q3TIR1 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc13Q3TIR1 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc13Q3TIR1 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc13Q3TIR1 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc13Q3TIR1 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc13Q3TIR1 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc13Q3TIR1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc13Q3TIR1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc13Q3TIR1 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc13Q3TIR1 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc13Q3TIR1 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc13Q3TIR1 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc13Q3TIR1 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc13Q3TIR1 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc13Q3TIR1 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc13Q3TIR1 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc13Q3TIR1 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc13Q3TIR1 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc13Q3TIR1 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc13Q3TIR1 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc13Q3TIR1 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc13Q3TIR1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc13Q3TIR1 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc13Q3TIR1 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc13Q3TIR1 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc13Q3TIR1 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc13Q3TIR1 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trappc13Q3TIR1 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trappc13Q3TIR1 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trappc13Q3TIR1 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trappc13Q3TIR1 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trappc13Q3TIR1 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trappc13Q3TIR1 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms