Protein–RNA interactions for Protein: Q3THK3

Gtf2f1, General transcription factor IIF subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2f1Q3THK3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gtf2f1Q3THK3 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gtf2f1Q3THK3 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gtf2f1Q3THK3 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gtf2f1Q3THK3 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gtf2f1Q3THK3 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gtf2f1Q3THK3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gtf2f1Q3THK3 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gtf2f1Q3THK3 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gtf2f1Q3THK3 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gtf2f1Q3THK3 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gtf2f1Q3THK3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gtf2f1Q3THK3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gtf2f1Q3THK3 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gtf2f1Q3THK3 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gtf2f1Q3THK3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gtf2f1Q3THK3 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Gtf2f1Q3THK3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gtf2f1Q3THK3 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gtf2f1Q3THK3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gtf2f1Q3THK3 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gtf2f1Q3THK3 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gtf2f1Q3THK3 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gtf2f1Q3THK3 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gtf2f1Q3THK3 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gtf2f1Q3THK3 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gtf2f1Q3THK3 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gtf2f1Q3THK3 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gtf2f1Q3THK3 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Gtf2f1Q3THK3 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gtf2f1Q3THK3 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gtf2f1Q3THK3 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gtf2f1Q3THK3 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gtf2f1Q3THK3 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gtf2f1Q3THK3 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gtf2f1Q3THK3 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gtf2f1Q3THK3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gtf2f1Q3THK3 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gtf2f1Q3THK3 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gtf2f1Q3THK3 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gtf2f1Q3THK3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gtf2f1Q3THK3 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gtf2f1Q3THK3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gtf2f1Q3THK3 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gtf2f1Q3THK3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gtf2f1Q3THK3 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gtf2f1Q3THK3 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gtf2f1Q3THK3 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gtf2f1Q3THK3 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gtf2f1Q3THK3 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gtf2f1Q3THK3 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gtf2f1Q3THK3 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gtf2f1Q3THK3 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gtf2f1Q3THK3 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gtf2f1Q3THK3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gtf2f1Q3THK3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gtf2f1Q3THK3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gtf2f1Q3THK3 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gtf2f1Q3THK3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gtf2f1Q3THK3 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gtf2f1Q3THK3 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gtf2f1Q3THK3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gtf2f1Q3THK3 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gtf2f1Q3THK3 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gtf2f1Q3THK3 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gtf2f1Q3THK3 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Gtf2f1Q3THK3 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gtf2f1Q3THK3 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gtf2f1Q3THK3 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gtf2f1Q3THK3 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gtf2f1Q3THK3 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gtf2f1Q3THK3 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gtf2f1Q3THK3 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gtf2f1Q3THK3 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gtf2f1Q3THK3 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gtf2f1Q3THK3 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gtf2f1Q3THK3 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gtf2f1Q3THK3 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gtf2f1Q3THK3 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gtf2f1Q3THK3 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gtf2f1Q3THK3 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gtf2f1Q3THK3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gtf2f1Q3THK3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gtf2f1Q3THK3 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Gtf2f1Q3THK3 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gtf2f1Q3THK3 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Gtf2f1Q3THK3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gtf2f1Q3THK3 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gtf2f1Q3THK3 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gtf2f1Q3THK3 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gtf2f1Q3THK3 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gtf2f1Q3THK3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gtf2f1Q3THK3 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gtf2f1Q3THK3 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gtf2f1Q3THK3 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gtf2f1Q3THK3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gtf2f1Q3THK3 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gtf2f1Q3THK3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gtf2f1Q3THK3 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gtf2f1Q3THK3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms