Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNY5

Riiad1, RIIa domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riiad1Q3KNY5 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Riiad1Q3KNY5 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Riiad1Q3KNY5 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Riiad1Q3KNY5 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Riiad1Q3KNY5 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Riiad1Q3KNY5 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Riiad1Q3KNY5 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Riiad1Q3KNY5 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Riiad1Q3KNY5 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Riiad1Q3KNY5 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Riiad1Q3KNY5 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Riiad1Q3KNY5 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Riiad1Q3KNY5 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Riiad1Q3KNY5 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Riiad1Q3KNY5 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Riiad1Q3KNY5 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Riiad1Q3KNY5 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Riiad1Q3KNY5 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Riiad1Q3KNY5 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Riiad1Q3KNY5 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Riiad1Q3KNY5 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Riiad1Q3KNY5 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Riiad1Q3KNY5 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Riiad1Q3KNY5 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Riiad1Q3KNY5 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Riiad1Q3KNY5 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Riiad1Q3KNY5 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Riiad1Q3KNY5 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Riiad1Q3KNY5 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Riiad1Q3KNY5 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Riiad1Q3KNY5 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Riiad1Q3KNY5 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Riiad1Q3KNY5 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Riiad1Q3KNY5 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Riiad1Q3KNY5 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Riiad1Q3KNY5 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Riiad1Q3KNY5 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Riiad1Q3KNY5 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Riiad1Q3KNY5 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Riiad1Q3KNY5 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Riiad1Q3KNY5 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Riiad1Q3KNY5 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Riiad1Q3KNY5 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Riiad1Q3KNY5 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Riiad1Q3KNY5 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Riiad1Q3KNY5 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Riiad1Q3KNY5 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Riiad1Q3KNY5 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Riiad1Q3KNY5 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Riiad1Q3KNY5 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Riiad1Q3KNY5 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Riiad1Q3KNY5 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Riiad1Q3KNY5 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Riiad1Q3KNY5 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Riiad1Q3KNY5 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Riiad1Q3KNY5 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Riiad1Q3KNY5 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Riiad1Q3KNY5 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Riiad1Q3KNY5 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Riiad1Q3KNY5 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Riiad1Q3KNY5 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Riiad1Q3KNY5 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Riiad1Q3KNY5 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Riiad1Q3KNY5 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Riiad1Q3KNY5 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Riiad1Q3KNY5 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Riiad1Q3KNY5 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Riiad1Q3KNY5 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Riiad1Q3KNY5 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Riiad1Q3KNY5 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Riiad1Q3KNY5 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Riiad1Q3KNY5 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Riiad1Q3KNY5 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Riiad1Q3KNY5 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Riiad1Q3KNY5 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Riiad1Q3KNY5 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Riiad1Q3KNY5 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Riiad1Q3KNY5 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Riiad1Q3KNY5 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Riiad1Q3KNY5 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Riiad1Q3KNY5 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Riiad1Q3KNY5 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Riiad1Q3KNY5 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Riiad1Q3KNY5 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Riiad1Q3KNY5 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Riiad1Q3KNY5 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Riiad1Q3KNY5 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Riiad1Q3KNY5 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Riiad1Q3KNY5 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Riiad1Q3KNY5 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Riiad1Q3KNY5 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Riiad1Q3KNY5 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Riiad1Q3KNY5 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Riiad1Q3KNY5 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Riiad1Q3KNY5 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Riiad1Q3KNY5 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Riiad1Q3KNY5 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Riiad1Q3KNY5 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Riiad1Q3KNY5 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Riiad1Q3KNY5 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms