Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7T1

EDRF1, Erythroid differentiation-related factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1Q3B7T1 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EDRF1Q3B7T1 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EDRF1Q3B7T1 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EDRF1Q3B7T1 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EDRF1Q3B7T1 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EDRF1Q3B7T1 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EDRF1Q3B7T1 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EDRF1Q3B7T1 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EDRF1Q3B7T1 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EDRF1Q3B7T1 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EDRF1Q3B7T1 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EDRF1Q3B7T1 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EDRF1Q3B7T1 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EDRF1Q3B7T1 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EDRF1Q3B7T1 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EDRF1Q3B7T1 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EDRF1Q3B7T1 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EDRF1Q3B7T1 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EDRF1Q3B7T1 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EDRF1Q3B7T1 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
EDRF1Q3B7T1 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EDRF1Q3B7T1 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EDRF1Q3B7T1 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
EDRF1Q3B7T1 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EDRF1Q3B7T1 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EDRF1Q3B7T1 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EDRF1Q3B7T1 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EDRF1Q3B7T1 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EDRF1Q3B7T1 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EDRF1Q3B7T1 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EDRF1Q3B7T1 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EDRF1Q3B7T1 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EDRF1Q3B7T1 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EDRF1Q3B7T1 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EDRF1Q3B7T1 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EDRF1Q3B7T1 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EDRF1Q3B7T1 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EDRF1Q3B7T1 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EDRF1Q3B7T1 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EDRF1Q3B7T1 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EDRF1Q3B7T1 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
EDRF1Q3B7T1 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EDRF1Q3B7T1 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EDRF1Q3B7T1 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EDRF1Q3B7T1 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EDRF1Q3B7T1 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EDRF1Q3B7T1 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EDRF1Q3B7T1 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EDRF1Q3B7T1 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EDRF1Q3B7T1 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EDRF1Q3B7T1 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EDRF1Q3B7T1 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EDRF1Q3B7T1 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
EDRF1Q3B7T1 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
EDRF1Q3B7T1 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EDRF1Q3B7T1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EDRF1Q3B7T1 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EDRF1Q3B7T1 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
EDRF1Q3B7T1 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EDRF1Q3B7T1 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EDRF1Q3B7T1 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EDRF1Q3B7T1 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EDRF1Q3B7T1 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EDRF1Q3B7T1 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EDRF1Q3B7T1 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
EDRF1Q3B7T1 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
EDRF1Q3B7T1 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EDRF1Q3B7T1 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EDRF1Q3B7T1 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EDRF1Q3B7T1 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EDRF1Q3B7T1 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EDRF1Q3B7T1 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EDRF1Q3B7T1 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EDRF1Q3B7T1 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EDRF1Q3B7T1 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EDRF1Q3B7T1 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EDRF1Q3B7T1 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EDRF1Q3B7T1 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EDRF1Q3B7T1 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EDRF1Q3B7T1 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
EDRF1Q3B7T1 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EDRF1Q3B7T1 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EDRF1Q3B7T1 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EDRF1Q3B7T1 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EDRF1Q3B7T1 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
EDRF1Q3B7T1 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EDRF1Q3B7T1 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EDRF1Q3B7T1 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EDRF1Q3B7T1 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EDRF1Q3B7T1 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
EDRF1Q3B7T1 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
EDRF1Q3B7T1 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
EDRF1Q3B7T1 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
EDRF1Q3B7T1 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EDRF1Q3B7T1 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EDRF1Q3B7T1 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EDRF1Q3B7T1 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EDRF1Q3B7T1 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EDRF1Q3B7T1 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EDRF1Q3B7T1 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms