Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

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Length 542 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Samd11Q1RNF8 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Samd11Q1RNF8 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Samd11Q1RNF8 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Samd11Q1RNF8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Samd11Q1RNF8 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Samd11Q1RNF8 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Samd11Q1RNF8 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Samd11Q1RNF8 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Samd11Q1RNF8 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Samd11Q1RNF8 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Samd11Q1RNF8 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Samd11Q1RNF8 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Samd11Q1RNF8 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Samd11Q1RNF8 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Samd11Q1RNF8 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Samd11Q1RNF8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Samd11Q1RNF8 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Samd11Q1RNF8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Samd11Q1RNF8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Samd11Q1RNF8 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Samd11Q1RNF8 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Samd11Q1RNF8 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Samd11Q1RNF8 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Samd11Q1RNF8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Samd11Q1RNF8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Samd11Q1RNF8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Samd11Q1RNF8 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Samd11Q1RNF8 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Samd11Q1RNF8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Samd11Q1RNF8 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Samd11Q1RNF8 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Samd11Q1RNF8 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Samd11Q1RNF8 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Samd11Q1RNF8 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Samd11Q1RNF8 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Samd11Q1RNF8 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Samd11Q1RNF8 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Samd11Q1RNF8 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Samd11Q1RNF8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Samd11Q1RNF8 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Samd11Q1RNF8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Samd11Q1RNF8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Samd11Q1RNF8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Samd11Q1RNF8 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Samd11Q1RNF8 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Samd11Q1RNF8 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Samd11Q1RNF8 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Samd11Q1RNF8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Samd11Q1RNF8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Samd11Q1RNF8 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Samd11Q1RNF8 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Samd11Q1RNF8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Samd11Q1RNF8 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Samd11Q1RNF8 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Samd11Q1RNF8 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Samd11Q1RNF8 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Samd11Q1RNF8 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Samd11Q1RNF8 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Samd11Q1RNF8 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Samd11Q1RNF8 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Samd11Q1RNF8 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Samd11Q1RNF8 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Samd11Q1RNF8 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Samd11Q1RNF8 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Samd11Q1RNF8 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Samd11Q1RNF8 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Samd11Q1RNF8 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Samd11Q1RNF8 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Samd11Q1RNF8 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Samd11Q1RNF8 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Samd11Q1RNF8 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Samd11Q1RNF8 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Samd11Q1RNF8 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Samd11Q1RNF8 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Samd11Q1RNF8 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Samd11Q1RNF8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Samd11Q1RNF8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Samd11Q1RNF8 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Samd11Q1RNF8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Samd11Q1RNF8 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Samd11Q1RNF8 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Samd11Q1RNF8 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Samd11Q1RNF8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Samd11Q1RNF8 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Samd11Q1RNF8 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Samd11Q1RNF8 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Samd11Q1RNF8 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Samd11Q1RNF8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Samd11Q1RNF8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Samd11Q1RNF8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Samd11Q1RNF8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Samd11Q1RNF8 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Samd11Q1RNF8 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Samd11Q1RNF8 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Samd11Q1RNF8 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Samd11Q1RNF8 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Samd11Q1RNF8 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Samd11Q1RNF8 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Samd11Q1RNF8 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
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