Protein–RNA interactions for Protein: Q08EC4

Cass4, Cas scaffolding protein family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cass4Q08EC4 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cass4Q08EC4 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cass4Q08EC4 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cass4Q08EC4 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Cass4Q08EC4 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cass4Q08EC4 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cass4Q08EC4 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cass4Q08EC4 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cass4Q08EC4 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cass4Q08EC4 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cass4Q08EC4 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cass4Q08EC4 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cass4Q08EC4 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cass4Q08EC4 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cass4Q08EC4 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Cass4Q08EC4 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Cass4Q08EC4 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cass4Q08EC4 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cass4Q08EC4 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cass4Q08EC4 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cass4Q08EC4 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cass4Q08EC4 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cass4Q08EC4 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cass4Q08EC4 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cass4Q08EC4 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cass4Q08EC4 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cass4Q08EC4 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cass4Q08EC4 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cass4Q08EC4 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cass4Q08EC4 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cass4Q08EC4 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cass4Q08EC4 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cass4Q08EC4 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cass4Q08EC4 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cass4Q08EC4 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cass4Q08EC4 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cass4Q08EC4 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cass4Q08EC4 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cass4Q08EC4 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cass4Q08EC4 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cass4Q08EC4 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cass4Q08EC4 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cass4Q08EC4 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cass4Q08EC4 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cass4Q08EC4 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cass4Q08EC4 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cass4Q08EC4 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cass4Q08EC4 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cass4Q08EC4 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cass4Q08EC4 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cass4Q08EC4 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cass4Q08EC4 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cass4Q08EC4 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cass4Q08EC4 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cass4Q08EC4 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cass4Q08EC4 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cass4Q08EC4 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cass4Q08EC4 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cass4Q08EC4 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cass4Q08EC4 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cass4Q08EC4 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cass4Q08EC4 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cass4Q08EC4 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cass4Q08EC4 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cass4Q08EC4 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cass4Q08EC4 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cass4Q08EC4 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cass4Q08EC4 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cass4Q08EC4 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cass4Q08EC4 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cass4Q08EC4 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cass4Q08EC4 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cass4Q08EC4 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cass4Q08EC4 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cass4Q08EC4 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cass4Q08EC4 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cass4Q08EC4 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Cass4Q08EC4 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cass4Q08EC4 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cass4Q08EC4 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cass4Q08EC4 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cass4Q08EC4 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cass4Q08EC4 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cass4Q08EC4 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cass4Q08EC4 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cass4Q08EC4 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cass4Q08EC4 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cass4Q08EC4 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cass4Q08EC4 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cass4Q08EC4 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cass4Q08EC4 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cass4Q08EC4 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cass4Q08EC4 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cass4Q08EC4 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Cass4Q08EC4 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cass4Q08EC4 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cass4Q08EC4 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cass4Q08EC4 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cass4Q08EC4 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cass4Q08EC4 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms