Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cab39Q06138 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cab39Q06138 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cab39Q06138 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cab39Q06138 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cab39Q06138 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cab39Q06138 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cab39Q06138 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cab39Q06138 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cab39Q06138 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cab39Q06138 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Cab39Q06138 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cab39Q06138 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cab39Q06138 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cab39Q06138 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cab39Q06138 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cab39Q06138 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cab39Q06138 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cab39Q06138 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cab39Q06138 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cab39Q06138 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cab39Q06138 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cab39Q06138 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cab39Q06138 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cab39Q06138 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cab39Q06138 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cab39Q06138 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Cab39Q06138 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cab39Q06138 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cab39Q06138 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cab39Q06138 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cab39Q06138 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cab39Q06138 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cab39Q06138 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cab39Q06138 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cab39Q06138 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cab39Q06138 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cab39Q06138 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cab39Q06138 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cab39Q06138 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cab39Q06138 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cab39Q06138 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Cab39Q06138 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cab39Q06138 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cab39Q06138 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cab39Q06138 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cab39Q06138 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cab39Q06138 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cab39Q06138 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cab39Q06138 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cab39Q06138 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cab39Q06138 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cab39Q06138 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cab39Q06138 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cab39Q06138 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cab39Q06138 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cab39Q06138 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cab39Q06138 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cab39Q06138 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cab39Q06138 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cab39Q06138 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cab39Q06138 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cab39Q06138 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cab39Q06138 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cab39Q06138 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cab39Q06138 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Cab39Q06138 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cab39Q06138 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cab39Q06138 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cab39Q06138 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cab39Q06138 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cab39Q06138 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cab39Q06138 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cab39Q06138 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cab39Q06138 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cab39Q06138 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cab39Q06138 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Cab39Q06138 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cab39Q06138 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Cab39Q06138 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cab39Q06138 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cab39Q06138 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cab39Q06138 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cab39Q06138 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cab39Q06138 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cab39Q06138 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cab39Q06138 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cab39Q06138 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cab39Q06138 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cab39Q06138 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cab39Q06138 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cab39Q06138 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cab39Q06138 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cab39Q06138 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cab39Q06138 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cab39Q06138 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cab39Q06138 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cab39Q06138 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cab39Q06138 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cab39Q06138 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms