Protein–RNA interactions for Protein: Q05909

Ptprg, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, mousemouse

Predictions only

Length 1,442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprgQ05909 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PtprgQ05909 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PtprgQ05909 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PtprgQ05909 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PtprgQ05909 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PtprgQ05909 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PtprgQ05909 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PtprgQ05909 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PtprgQ05909 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
PtprgQ05909 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PtprgQ05909 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PtprgQ05909 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PtprgQ05909 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PtprgQ05909 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PtprgQ05909 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PtprgQ05909 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PtprgQ05909 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PtprgQ05909 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PtprgQ05909 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PtprgQ05909 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PtprgQ05909 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PtprgQ05909 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PtprgQ05909 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PtprgQ05909 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PtprgQ05909 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
PtprgQ05909 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PtprgQ05909 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PtprgQ05909 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PtprgQ05909 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PtprgQ05909 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PtprgQ05909 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PtprgQ05909 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PtprgQ05909 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PtprgQ05909 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PtprgQ05909 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PtprgQ05909 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PtprgQ05909 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PtprgQ05909 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PtprgQ05909 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PtprgQ05909 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PtprgQ05909 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PtprgQ05909 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PtprgQ05909 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PtprgQ05909 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PtprgQ05909 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PtprgQ05909 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PtprgQ05909 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PtprgQ05909 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PtprgQ05909 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PtprgQ05909 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PtprgQ05909 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PtprgQ05909 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PtprgQ05909 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PtprgQ05909 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
PtprgQ05909 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PtprgQ05909 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PtprgQ05909 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PtprgQ05909 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PtprgQ05909 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PtprgQ05909 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PtprgQ05909 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PtprgQ05909 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PtprgQ05909 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PtprgQ05909 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
PtprgQ05909 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PtprgQ05909 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PtprgQ05909 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PtprgQ05909 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PtprgQ05909 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PtprgQ05909 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PtprgQ05909 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PtprgQ05909 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PtprgQ05909 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PtprgQ05909 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PtprgQ05909 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PtprgQ05909 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PtprgQ05909 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PtprgQ05909 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PtprgQ05909 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PtprgQ05909 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PtprgQ05909 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PtprgQ05909 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PtprgQ05909 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PtprgQ05909 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PtprgQ05909 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PtprgQ05909 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
PtprgQ05909 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PtprgQ05909 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PtprgQ05909 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PtprgQ05909 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PtprgQ05909 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PtprgQ05909 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PtprgQ05909 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PtprgQ05909 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PtprgQ05909 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PtprgQ05909 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PtprgQ05909 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PtprgQ05909 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PtprgQ05909 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PtprgQ05909 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms