Protein–RNA interactions for Protein: Q05722

Col9a1, Collagen alpha-1(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a1Q05722 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Col9a1Q05722 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Col9a1Q05722 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Col9a1Q05722 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Col9a1Q05722 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Col9a1Q05722 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Col9a1Q05722 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Col9a1Q05722 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Col9a1Q05722 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Col9a1Q05722 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Col9a1Q05722 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Col9a1Q05722 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Col9a1Q05722 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Col9a1Q05722 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Col9a1Q05722 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Col9a1Q05722 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Col9a1Q05722 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Col9a1Q05722 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Col9a1Q05722 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Col9a1Q05722 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Col9a1Q05722 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Col9a1Q05722 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Col9a1Q05722 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Col9a1Q05722 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Col9a1Q05722 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Col9a1Q05722 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Col9a1Q05722 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Col9a1Q05722 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Col9a1Q05722 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Col9a1Q05722 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Col9a1Q05722 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Col9a1Q05722 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Col9a1Q05722 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Col9a1Q05722 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Col9a1Q05722 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Col9a1Q05722 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Col9a1Q05722 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Col9a1Q05722 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Col9a1Q05722 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Col9a1Q05722 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Col9a1Q05722 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Col9a1Q05722 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Col9a1Q05722 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Col9a1Q05722 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Col9a1Q05722 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Col9a1Q05722 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Col9a1Q05722 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Col9a1Q05722 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Col9a1Q05722 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Col9a1Q05722 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Col9a1Q05722 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Col9a1Q05722 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Col9a1Q05722 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Col9a1Q05722 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Col9a1Q05722 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Col9a1Q05722 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Col9a1Q05722 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Col9a1Q05722 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Col9a1Q05722 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Col9a1Q05722 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Col9a1Q05722 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Col9a1Q05722 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Col9a1Q05722 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Col9a1Q05722 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Col9a1Q05722 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Col9a1Q05722 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Col9a1Q05722 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Col9a1Q05722 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Col9a1Q05722 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Col9a1Q05722 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Col9a1Q05722 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Col9a1Q05722 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Col9a1Q05722 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Col9a1Q05722 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Col9a1Q05722 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Col9a1Q05722 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Col9a1Q05722 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Col9a1Q05722 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Col9a1Q05722 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Col9a1Q05722 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Col9a1Q05722 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Col9a1Q05722 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Col9a1Q05722 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Col9a1Q05722 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Col9a1Q05722 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Col9a1Q05722 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Col9a1Q05722 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Col9a1Q05722 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Col9a1Q05722 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Col9a1Q05722 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Col9a1Q05722 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Col9a1Q05722 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Col9a1Q05722 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Col9a1Q05722 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Col9a1Q05722 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Col9a1Q05722 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Col9a1Q05722 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Col9a1Q05722 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Col9a1Q05722 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Col9a1Q05722 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.6 ms