Protein–RNA interactions for Protein: Q04891

Sox13, Transcription factor SOX-13, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox13Q04891 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sox13Q04891 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sox13Q04891 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sox13Q04891 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sox13Q04891 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sox13Q04891 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sox13Q04891 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sox13Q04891 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Sox13Q04891 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Sox13Q04891 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sox13Q04891 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sox13Q04891 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sox13Q04891 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sox13Q04891 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sox13Q04891 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sox13Q04891 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sox13Q04891 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sox13Q04891 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sox13Q04891 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sox13Q04891 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sox13Q04891 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sox13Q04891 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sox13Q04891 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sox13Q04891 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sox13Q04891 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sox13Q04891 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sox13Q04891 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sox13Q04891 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Sox13Q04891 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sox13Q04891 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sox13Q04891 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sox13Q04891 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sox13Q04891 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sox13Q04891 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sox13Q04891 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sox13Q04891 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sox13Q04891 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Sox13Q04891 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sox13Q04891 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sox13Q04891 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sox13Q04891 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sox13Q04891 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sox13Q04891 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sox13Q04891 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sox13Q04891 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sox13Q04891 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sox13Q04891 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sox13Q04891 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sox13Q04891 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Sox13Q04891 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sox13Q04891 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sox13Q04891 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sox13Q04891 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Sox13Q04891 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sox13Q04891 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sox13Q04891 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sox13Q04891 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sox13Q04891 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sox13Q04891 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sox13Q04891 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sox13Q04891 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sox13Q04891 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sox13Q04891 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sox13Q04891 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sox13Q04891 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sox13Q04891 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sox13Q04891 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sox13Q04891 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sox13Q04891 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sox13Q04891 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sox13Q04891 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sox13Q04891 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sox13Q04891 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sox13Q04891 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Sox13Q04891 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sox13Q04891 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sox13Q04891 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sox13Q04891 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sox13Q04891 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sox13Q04891 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sox13Q04891 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sox13Q04891 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sox13Q04891 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sox13Q04891 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sox13Q04891 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sox13Q04891 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sox13Q04891 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sox13Q04891 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sox13Q04891 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sox13Q04891 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sox13Q04891 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sox13Q04891 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sox13Q04891 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sox13Q04891 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sox13Q04891 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Sox13Q04891 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sox13Q04891 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Sox13Q04891 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sox13Q04891 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sox13Q04891 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms