Protein–RNA interactions for Protein: Q04887

Sox9, Transcription factor SOX-9, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox9Q04887 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sox9Q04887 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sox9Q04887 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sox9Q04887 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sox9Q04887 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sox9Q04887 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sox9Q04887 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Sox9Q04887 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sox9Q04887 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sox9Q04887 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Sox9Q04887 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sox9Q04887 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sox9Q04887 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sox9Q04887 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sox9Q04887 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sox9Q04887 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sox9Q04887 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sox9Q04887 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sox9Q04887 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sox9Q04887 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sox9Q04887 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sox9Q04887 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sox9Q04887 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sox9Q04887 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Sox9Q04887 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sox9Q04887 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sox9Q04887 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sox9Q04887 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sox9Q04887 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sox9Q04887 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sox9Q04887 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sox9Q04887 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sox9Q04887 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sox9Q04887 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sox9Q04887 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sox9Q04887 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sox9Q04887 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sox9Q04887 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sox9Q04887 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sox9Q04887 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sox9Q04887 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sox9Q04887 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sox9Q04887 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sox9Q04887 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sox9Q04887 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sox9Q04887 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sox9Q04887 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sox9Q04887 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sox9Q04887 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sox9Q04887 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sox9Q04887 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sox9Q04887 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sox9Q04887 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sox9Q04887 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sox9Q04887 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sox9Q04887 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sox9Q04887 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sox9Q04887 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sox9Q04887 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sox9Q04887 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sox9Q04887 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sox9Q04887 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sox9Q04887 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sox9Q04887 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sox9Q04887 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sox9Q04887 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sox9Q04887 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sox9Q04887 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Sox9Q04887 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sox9Q04887 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sox9Q04887 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sox9Q04887 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sox9Q04887 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sox9Q04887 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sox9Q04887 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sox9Q04887 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sox9Q04887 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sox9Q04887 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sox9Q04887 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sox9Q04887 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sox9Q04887 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sox9Q04887 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sox9Q04887 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sox9Q04887 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sox9Q04887 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Sox9Q04887 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sox9Q04887 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sox9Q04887 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sox9Q04887 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sox9Q04887 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sox9Q04887 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sox9Q04887 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sox9Q04887 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sox9Q04887 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Sox9Q04887 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sox9Q04887 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sox9Q04887 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sox9Q04887 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sox9Q04887 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Sox9Q04887 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms