Protein–RNA interactions for Protein: Q04750

Top1, DNA topoisomerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1Q04750 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Top1Q04750 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Top1Q04750 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Top1Q04750 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Top1Q04750 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Top1Q04750 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Top1Q04750 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Top1Q04750 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Top1Q04750 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Top1Q04750 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Top1Q04750 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Top1Q04750 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Top1Q04750 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Top1Q04750 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Top1Q04750 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Top1Q04750 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Top1Q04750 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Top1Q04750 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Top1Q04750 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Top1Q04750 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Top1Q04750 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Top1Q04750 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Top1Q04750 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Top1Q04750 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Top1Q04750 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Top1Q04750 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Top1Q04750 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Top1Q04750 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Top1Q04750 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Top1Q04750 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Top1Q04750 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Top1Q04750 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Top1Q04750 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Top1Q04750 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Top1Q04750 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Top1Q04750 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Top1Q04750 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Top1Q04750 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Top1Q04750 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Top1Q04750 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Top1Q04750 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Top1Q04750 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Top1Q04750 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Top1Q04750 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Top1Q04750 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Top1Q04750 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Top1Q04750 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Top1Q04750 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Top1Q04750 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Top1Q04750 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Top1Q04750 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Top1Q04750 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Top1Q04750 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Top1Q04750 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Top1Q04750 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Top1Q04750 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Top1Q04750 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Top1Q04750 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Top1Q04750 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Top1Q04750 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Top1Q04750 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Top1Q04750 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Top1Q04750 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Top1Q04750 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Top1Q04750 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Top1Q04750 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Top1Q04750 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Top1Q04750 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Top1Q04750 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Top1Q04750 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Top1Q04750 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Top1Q04750 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Top1Q04750 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Top1Q04750 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Top1Q04750 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Top1Q04750 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Top1Q04750 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Top1Q04750 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Top1Q04750 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Top1Q04750 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Top1Q04750 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Top1Q04750 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Top1Q04750 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Top1Q04750 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Top1Q04750 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Top1Q04750 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Top1Q04750 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Top1Q04750 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Top1Q04750 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Top1Q04750 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Top1Q04750 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Top1Q04750 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Top1Q04750 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Top1Q04750 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Top1Q04750 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Top1Q04750 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Top1Q04750 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Top1Q04750 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Top1Q04750 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Top1Q04750 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms