Protein–RNA interactions for Protein: Q04519

Smpd1, Sphingomyelin phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd1Q04519 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smpd1Q04519 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smpd1Q04519 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smpd1Q04519 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smpd1Q04519 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smpd1Q04519 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smpd1Q04519 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smpd1Q04519 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Smpd1Q04519 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smpd1Q04519 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smpd1Q04519 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smpd1Q04519 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smpd1Q04519 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smpd1Q04519 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Smpd1Q04519 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smpd1Q04519 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smpd1Q04519 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smpd1Q04519 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smpd1Q04519 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smpd1Q04519 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smpd1Q04519 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Smpd1Q04519 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smpd1Q04519 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smpd1Q04519 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smpd1Q04519 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smpd1Q04519 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smpd1Q04519 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smpd1Q04519 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smpd1Q04519 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smpd1Q04519 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smpd1Q04519 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smpd1Q04519 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smpd1Q04519 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smpd1Q04519 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smpd1Q04519 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smpd1Q04519 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smpd1Q04519 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smpd1Q04519 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smpd1Q04519 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smpd1Q04519 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smpd1Q04519 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smpd1Q04519 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Smpd1Q04519 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smpd1Q04519 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smpd1Q04519 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smpd1Q04519 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smpd1Q04519 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Smpd1Q04519 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smpd1Q04519 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smpd1Q04519 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smpd1Q04519 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smpd1Q04519 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smpd1Q04519 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smpd1Q04519 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smpd1Q04519 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smpd1Q04519 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smpd1Q04519 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smpd1Q04519 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smpd1Q04519 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smpd1Q04519 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smpd1Q04519 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smpd1Q04519 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smpd1Q04519 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smpd1Q04519 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smpd1Q04519 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smpd1Q04519 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smpd1Q04519 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smpd1Q04519 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smpd1Q04519 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smpd1Q04519 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smpd1Q04519 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smpd1Q04519 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smpd1Q04519 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Smpd1Q04519 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Smpd1Q04519 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Smpd1Q04519 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smpd1Q04519 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smpd1Q04519 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smpd1Q04519 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smpd1Q04519 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smpd1Q04519 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smpd1Q04519 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smpd1Q04519 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smpd1Q04519 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smpd1Q04519 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smpd1Q04519 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smpd1Q04519 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smpd1Q04519 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smpd1Q04519 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smpd1Q04519 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Smpd1Q04519 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smpd1Q04519 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smpd1Q04519 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smpd1Q04519 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smpd1Q04519 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smpd1Q04519 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smpd1Q04519 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smpd1Q04519 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smpd1Q04519 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Smpd1Q04519 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms