Protein–RNA interactions for Protein: Q04116

YHP1, Homeobox protein YHP1, yeastyeast

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHP1Q04116 SNQ2YDR011W 4506 nt2.46□□□□□ -2.02
YHP1Q04116 UBP14YBR058C 2346 nt2.46□□□□□ -2.02
YHP1Q04116 UBP5YER144C 2418 nt2.46□□□□□ -2.02
YHP1Q04116 MAK21YDR060W 3078 nt2.45□□□□□ -2.02
YHP1Q04116 NMD2YHR077C 3270 nt2.45□□□□□ -2.02
YHP1Q04116 YHR202WYHR202W 1809 nt2.45□□□□□ -2.02
YHP1Q04116 APA2YDR530C 978 nt2.45□□□□□ -2.02
YHP1Q04116 YGR273CYGR273C 525 nt2.45□□□□□ -2.02
YHP1Q04116 ERV29YGR284C 933 nt2.45□□□□□ -2.02
YHP1Q04116 YPL107WYPL107W 747 nt2.45□□□□□ -2.02
YHP1Q04116 RCY1YJL204C 2523 nt2.45□□□□□ -2.02
YHP1Q04116 POL3YDL102W 3294 nt2.45□□□□□ -2.02
YHP1Q04116 PUS9YDL036C 1389 nt2.45□□□□□ -2.02
YHP1Q04116 ITC1YGL133W 3795 nt2.45□□□□□ -2.02
YHP1Q04116 ERG11YHR007C 1593 nt2.44□□□□□ -2.02
YHP1Q04116 COM2YER130C 1332 nt2.44□□□□□ -2.02
YHP1Q04116 PMR1YGL167C 2853 nt2.44□□□□□ -2.02
YHP1Q04116 FRQ1YDR373W 573 nt2.44□□□□□ -2.02
YHP1Q04116 HAT2YEL056W 1206 nt2.44□□□□□ -2.02
YHP1Q04116 TOS8YGL096W 831 nt2.44□□□□□ -2.02
YHP1Q04116 SDT1YGL224C 843 nt2.44□□□□□ -2.02
YHP1Q04116 MRPS35YGR165W 1038 nt2.44□□□□□ -2.02
YHP1Q04116 QCR10YHR001W-A 234 nt2.44□□□□□ -2.02
YHP1Q04116 YIL025CYIL025C 375 nt2.44□□□□□ -2.02
YHP1Q04116 YJL175WYJL175W 513 nt2.44□□□□□ -2.02
YHP1Q04116 YJR111CYJR111C 852 nt2.44□□□□□ -2.02
YHP1Q04116 EMG1YLR186W 759 nt2.44□□□□□ -2.02
YHP1Q04116 YBL065WYBL065W 345 nt2.44□□□□□ -2.02
YHP1Q04116 OCA2YNL056W 594 nt2.44□□□□□ -2.02
YHP1Q04116 DDI3YNL335W 678 nt2.44□□□□□ -2.02
YHP1Q04116 DGA1YOR245C 1257 nt2.44□□□□□ -2.02
YHP1Q04116 BCS1YDR375C 1371 nt2.44□□□□□ -2.02
YHP1Q04116 FRE4YNR060W 2160 nt2.44□□□□□ -2.02
YHP1Q04116 SEC7YDR170C 6030 nt2.44□□□□□ -2.02
YHP1Q04116 TDA3YHR009C 1572 nt2.44□□□□□ -2.02
YHP1Q04116 PRR2YDL214C 2100 nt2.44□□□□□ -2.02
YHP1Q04116 YDL180WYDL180W 1644 nt2.43□□□□□ -2.02
YHP1Q04116 TRM1YDR120C 1713 nt2.43□□□□□ -2.02
YHP1Q04116 PAM1YDR251W 2493 nt2.43□□□□□ -2.02
YHP1Q04116 YDR249CYDR249C 1122 nt2.43□□□□□ -2.02
YHP1Q04116 SDH3YKL141W 597 nt2.43□□□□□ -2.02
YHP1Q04116 BUR2YLR226W 1188 nt2.43□□□□□ -2.02
YHP1Q04116 YIM2YMR151W 438 nt2.43□□□□□ -2.02
YHP1Q04116 MDJ2YNL328C 441 nt2.43□□□□□ -2.02
YHP1Q04116 BUD4YJR092W 4344 nt2.43□□□□□ -2.02
YHP1Q04116 HEH2YDR458C 1992 nt2.43□□□□□ -2.02
YHP1Q04116 DSN1YIR010W 1731 nt2.42□□□□□ -2.02
YHP1Q04116 MOT1YPL082C 5604 nt2.42□□□□□ -2.02
YHP1Q04116 GAT2YMR136W 1683 nt2.42□□□□□ -2.02
YHP1Q04116 MAK16YAL025C 921 nt2.42□□□□□ -2.02
YHP1Q04116 PHD1YKL043W 1101 nt2.42□□□□□ -2.02
YHP1Q04116 AHP1YLR109W 531 nt2.42□□□□□ -2.02
YHP1Q04116 COQ9YLR201C 783 nt2.42□□□□□ -2.02
YHP1Q04116 ERG2YMR202W 669 nt2.42□□□□□ -2.02
YHP1Q04116 FAA2YER015W 2235 nt2.42□□□□□ -2.02
YHP1Q04116 DSF2YBR007C 2211 nt2.42□□□□□ -2.02
YHP1Q04116 CEP3YMR168C 1827 nt2.42□□□□□ -2.02
YHP1Q04116 OAF3YKR064W 2592 nt2.42□□□□□ -2.02
YHP1Q04116 PHO5YBR093C 1404 nt2.42□□□□□ -2.02
YHP1Q04116 SRO9YCL037C 1305 nt2.42□□□□□ -2.02
YHP1Q04116 ATG13YPR185W 2217 nt2.41□□□□□ -2.02
YHP1Q04116 RKM4YDR257C 1485 nt2.41□□□□□ -2.02
YHP1Q04116 tC(GCA)BtC(GCA)B 72 nt2.41□□□□□ -2.02
YHP1Q04116 tC(GCA)GtC(GCA)G 72 nt2.41□□□□□ -2.02
YHP1Q04116 tC(GCA)P1tC(GCA)P1 72 nt2.41□□□□□ -2.02
YHP1Q04116 tC(GCA)P2tC(GCA)P2 72 nt2.41□□□□□ -2.02
YHP1Q04116 tF(GAA)DtF(GAA)D 73 nt2.41□□□□□ -2.02
YHP1Q04116 tF(GAA)NtF(GAA)N 73 nt2.41□□□□□ -2.02
YHP1Q04116 PPX1YHR201C 1194 nt2.41□□□□□ -2.02
YHP1Q04116 YVH1YIR026C 1095 nt2.41□□□□□ -2.02
YHP1Q04116 YKL091CYKL091C 933 nt2.41□□□□□ -2.02
YHP1Q04116 MRPL16YBL038W 699 nt2.41□□□□□ -2.02
YHP1Q04116 YBL039W-BYBL039W-B 180 nt2.41□□□□□ -2.02
YHP1Q04116 NDJ1YOL104C 1059 nt2.41□□□□□ -2.02
YHP1Q04116 OXR1YPL196W 822 nt2.41□□□□□ -2.02
YHP1Q04116 MCM16YPR046W 546 nt2.41□□□□□ -2.02
YHP1Q04116 FLO1YAR050W 4614 nt2.41□□□□□ -2.02
YHP1Q04116 BCH1YMR237W 2175 nt2.41□□□□□ -2.02
YHP1Q04116 YOR296WYOR296W 3870 nt2.41□□□□□ -2.02
YHP1Q04116 KAP104YBR017C 2757 nt2.41□□□□□ -2.02
YHP1Q04116 CCM1YGR150C 2595 nt2.41□□□□□ -2.02
YHP1Q04116 STP1YDR463W 1560 nt2.4□□□□□ -2.02
YHP1Q04116 MEF1YLR069C 2286 nt2.4□□□□□ -2.02
YHP1Q04116 WBP1YEL002C 1293 nt2.4□□□□□ -2.03
YHP1Q04116 YFL041W-AYFL041W-A 192 nt2.4□□□□□ -2.03
YHP1Q04116 YGR107WYGR107W 450 nt2.4□□□□□ -2.03
YHP1Q04116 YJL028WYJL028W 336 nt2.4□□□□□ -2.03
YHP1Q04116 RPS21BYJL136C 264 nt2.4□□□□□ -2.03
YHP1Q04116 YKL177WYKL177W 339 nt2.4□□□□□ -2.03
YHP1Q04116 MTR2YKL186C 555 nt2.4□□□□□ -2.03
YHP1Q04116 YLR154C-HYLR154C-H 132 nt2.4□□□□□ -2.03
YHP1Q04116 YLR156C-AYLR156C-A 132 nt2.4□□□□□ -2.03
YHP1Q04116 YLR157C-CYLR157C-C 132 nt2.4□□□□□ -2.03
YHP1Q04116 YLR159C-AYLR159C-A 132 nt2.4□□□□□ -2.03
YHP1Q04116 YLR326WYLR326W 723 nt2.4□□□□□ -2.03
YHP1Q04116 YLR402WYLR402W 192 nt2.4□□□□□ -2.03
YHP1Q04116 UNG1YML021C 1080 nt2.4□□□□□ -2.03
YHP1Q04116 PPA2YMR267W 933 nt2.4□□□□□ -2.03
YHP1Q04116 RRG9YNL213C 645 nt2.4□□□□□ -2.03
YHP1Q04116 PRE2YPR103W 864 nt2.4□□□□□ -2.03
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