Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Msx2Q03358 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Msx2Q03358 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Msx2Q03358 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Msx2Q03358 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Msx2Q03358 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Msx2Q03358 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Msx2Q03358 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Msx2Q03358 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Msx2Q03358 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Msx2Q03358 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Msx2Q03358 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Msx2Q03358 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Msx2Q03358 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Msx2Q03358 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Msx2Q03358 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Msx2Q03358 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Msx2Q03358 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Msx2Q03358 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Msx2Q03358 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Msx2Q03358 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Msx2Q03358 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Msx2Q03358 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Msx2Q03358 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Msx2Q03358 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Msx2Q03358 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Msx2Q03358 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Msx2Q03358 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Msx2Q03358 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Msx2Q03358 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Msx2Q03358 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Msx2Q03358 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Msx2Q03358 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Msx2Q03358 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Msx2Q03358 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Msx2Q03358 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Msx2Q03358 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Msx2Q03358 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Msx2Q03358 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Msx2Q03358 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Msx2Q03358 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Msx2Q03358 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Msx2Q03358 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Msx2Q03358 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Msx2Q03358 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Msx2Q03358 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Msx2Q03358 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Msx2Q03358 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Msx2Q03358 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Msx2Q03358 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Msx2Q03358 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Msx2Q03358 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Msx2Q03358 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Msx2Q03358 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Msx2Q03358 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Msx2Q03358 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Msx2Q03358 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Msx2Q03358 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Msx2Q03358 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Msx2Q03358 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Msx2Q03358 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Msx2Q03358 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Msx2Q03358 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Msx2Q03358 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Msx2Q03358 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Msx2Q03358 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Msx2Q03358 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Msx2Q03358 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Msx2Q03358 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Msx2Q03358 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Msx2Q03358 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Msx2Q03358 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Msx2Q03358 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Msx2Q03358 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Msx2Q03358 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Msx2Q03358 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Msx2Q03358 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Msx2Q03358 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Msx2Q03358 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Msx2Q03358 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Msx2Q03358 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Msx2Q03358 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Msx2Q03358 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Msx2Q03358 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Msx2Q03358 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Msx2Q03358 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Msx2Q03358 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Msx2Q03358 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Msx2Q03358 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Msx2Q03358 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Msx2Q03358 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Msx2Q03358 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Msx2Q03358 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Msx2Q03358 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Msx2Q03358 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Msx2Q03358 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Msx2Q03358 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Msx2Q03358 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Msx2Q03358 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Msx2Q03358 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms