Protein–RNA interactions for Protein: Q02650

Pax5, Paired box protein Pax-5, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax5Q02650 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pax5Q02650 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pax5Q02650 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pax5Q02650 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pax5Q02650 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pax5Q02650 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pax5Q02650 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pax5Q02650 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pax5Q02650 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pax5Q02650 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pax5Q02650 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pax5Q02650 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pax5Q02650 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pax5Q02650 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pax5Q02650 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pax5Q02650 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pax5Q02650 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pax5Q02650 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pax5Q02650 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pax5Q02650 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pax5Q02650 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pax5Q02650 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pax5Q02650 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pax5Q02650 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pax5Q02650 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pax5Q02650 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pax5Q02650 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pax5Q02650 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pax5Q02650 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pax5Q02650 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pax5Q02650 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pax5Q02650 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pax5Q02650 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pax5Q02650 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pax5Q02650 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pax5Q02650 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pax5Q02650 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pax5Q02650 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pax5Q02650 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pax5Q02650 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pax5Q02650 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pax5Q02650 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pax5Q02650 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pax5Q02650 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pax5Q02650 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pax5Q02650 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pax5Q02650 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pax5Q02650 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pax5Q02650 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pax5Q02650 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pax5Q02650 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pax5Q02650 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pax5Q02650 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Pax5Q02650 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pax5Q02650 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pax5Q02650 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pax5Q02650 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Pax5Q02650 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pax5Q02650 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pax5Q02650 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pax5Q02650 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pax5Q02650 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pax5Q02650 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pax5Q02650 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pax5Q02650 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pax5Q02650 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pax5Q02650 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pax5Q02650 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pax5Q02650 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pax5Q02650 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pax5Q02650 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pax5Q02650 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pax5Q02650 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pax5Q02650 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pax5Q02650 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pax5Q02650 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pax5Q02650 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pax5Q02650 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pax5Q02650 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pax5Q02650 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pax5Q02650 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pax5Q02650 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pax5Q02650 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pax5Q02650 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pax5Q02650 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pax5Q02650 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pax5Q02650 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pax5Q02650 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pax5Q02650 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pax5Q02650 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pax5Q02650 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pax5Q02650 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pax5Q02650 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pax5Q02650 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pax5Q02650 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pax5Q02650 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pax5Q02650 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pax5Q02650 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pax5Q02650 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pax5Q02650 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms