Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cacna1cQ01815 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cacna1cQ01815 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cacna1cQ01815 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cacna1cQ01815 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cacna1cQ01815 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cacna1cQ01815 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cacna1cQ01815 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cacna1cQ01815 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cacna1cQ01815 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cacna1cQ01815 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cacna1cQ01815 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cacna1cQ01815 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cacna1cQ01815 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cacna1cQ01815 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cacna1cQ01815 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cacna1cQ01815 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cacna1cQ01815 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cacna1cQ01815 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cacna1cQ01815 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cacna1cQ01815 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cacna1cQ01815 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cacna1cQ01815 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cacna1cQ01815 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cacna1cQ01815 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cacna1cQ01815 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cacna1cQ01815 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cacna1cQ01815 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cacna1cQ01815 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cacna1cQ01815 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Cacna1cQ01815 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cacna1cQ01815 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cacna1cQ01815 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Cacna1cQ01815 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cacna1cQ01815 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cacna1cQ01815 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Cacna1cQ01815 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Cacna1cQ01815 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacna1cQ01815 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacna1cQ01815 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacna1cQ01815 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacna1cQ01815 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacna1cQ01815 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacna1cQ01815 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacna1cQ01815 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacna1cQ01815 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacna1cQ01815 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacna1cQ01815 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacna1cQ01815 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacna1cQ01815 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacna1cQ01815 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacna1cQ01815 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacna1cQ01815 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacna1cQ01815 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacna1cQ01815 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacna1cQ01815 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacna1cQ01815 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacna1cQ01815 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacna1cQ01815 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacna1cQ01815 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacna1cQ01815 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacna1cQ01815 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacna1cQ01815 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacna1cQ01815 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacna1cQ01815 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacna1cQ01815 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacna1cQ01815 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacna1cQ01815 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacna1cQ01815 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacna1cQ01815 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacna1cQ01815 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacna1cQ01815 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacna1cQ01815 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacna1cQ01815 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacna1cQ01815 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacna1cQ01815 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacna1cQ01815 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacna1cQ01815 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacna1cQ01815 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacna1cQ01815 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacna1cQ01815 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacna1cQ01815 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacna1cQ01815 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacna1cQ01815 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacna1cQ01815 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacna1cQ01815 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacna1cQ01815 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacna1cQ01815 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacna1cQ01815 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacna1cQ01815 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacna1cQ01815 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacna1cQ01815 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacna1cQ01815 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacna1cQ01815 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacna1cQ01815 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacna1cQ01815 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacna1cQ01815 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacna1cQ01815 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacna1cQ01815 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacna1cQ01815 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms