Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Col1a2Q01149 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Col1a2Q01149 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Col1a2Q01149 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Col1a2Q01149 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Col1a2Q01149 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Col1a2Q01149 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Col1a2Q01149 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Col1a2Q01149 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Col1a2Q01149 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Col1a2Q01149 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Col1a2Q01149 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Col1a2Q01149 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Col1a2Q01149 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Col1a2Q01149 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Col1a2Q01149 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Col1a2Q01149 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Col1a2Q01149 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Col1a2Q01149 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Col1a2Q01149 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Col1a2Q01149 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Col1a2Q01149 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Col1a2Q01149 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Col1a2Q01149 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Col1a2Q01149 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Col1a2Q01149 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Col1a2Q01149 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Col1a2Q01149 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Col1a2Q01149 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Col1a2Q01149 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Col1a2Q01149 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Col1a2Q01149 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Col1a2Q01149 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Col1a2Q01149 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Col1a2Q01149 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Col1a2Q01149 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Col1a2Q01149 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Col1a2Q01149 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Col1a2Q01149 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Col1a2Q01149 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Col1a2Q01149 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Col1a2Q01149 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Col1a2Q01149 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Col1a2Q01149 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Col1a2Q01149 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Col1a2Q01149 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Col1a2Q01149 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Col1a2Q01149 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Col1a2Q01149 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Col1a2Q01149 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Col1a2Q01149 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Col1a2Q01149 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Col1a2Q01149 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Col1a2Q01149 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Col1a2Q01149 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Col1a2Q01149 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Col1a2Q01149 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Col1a2Q01149 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Col1a2Q01149 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Col1a2Q01149 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Col1a2Q01149 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Col1a2Q01149 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Col1a2Q01149 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Col1a2Q01149 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Col1a2Q01149 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Col1a2Q01149 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Col1a2Q01149 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Col1a2Q01149 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Col1a2Q01149 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Col1a2Q01149 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Col1a2Q01149 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Col1a2Q01149 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Col1a2Q01149 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Col1a2Q01149 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Col1a2Q01149 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Col1a2Q01149 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Col1a2Q01149 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Col1a2Q01149 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Col1a2Q01149 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Col1a2Q01149 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Col1a2Q01149 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Col1a2Q01149 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Col1a2Q01149 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Col1a2Q01149 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Col1a2Q01149 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Col1a2Q01149 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Col1a2Q01149 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Col1a2Q01149 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Col1a2Q01149 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Col1a2Q01149 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Col1a2Q01149 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Col1a2Q01149 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Col1a2Q01149 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Col1a2Q01149 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Col1a2Q01149 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Col1a2Q01149 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Col1a2Q01149 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Col1a2Q01149 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Col1a2Q01149 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Col1a2Q01149 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms