Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pde1bQ01065 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pde1bQ01065 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pde1bQ01065 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pde1bQ01065 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pde1bQ01065 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pde1bQ01065 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pde1bQ01065 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pde1bQ01065 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pde1bQ01065 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pde1bQ01065 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pde1bQ01065 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pde1bQ01065 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pde1bQ01065 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pde1bQ01065 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pde1bQ01065 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pde1bQ01065 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pde1bQ01065 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pde1bQ01065 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pde1bQ01065 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Pde1bQ01065 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pde1bQ01065 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pde1bQ01065 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pde1bQ01065 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pde1bQ01065 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Pde1bQ01065 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Pde1bQ01065 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pde1bQ01065 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pde1bQ01065 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pde1bQ01065 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pde1bQ01065 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pde1bQ01065 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Pde1bQ01065 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pde1bQ01065 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pde1bQ01065 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pde1bQ01065 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pde1bQ01065 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pde1bQ01065 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pde1bQ01065 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Pde1bQ01065 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pde1bQ01065 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pde1bQ01065 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pde1bQ01065 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pde1bQ01065 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pde1bQ01065 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pde1bQ01065 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pde1bQ01065 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pde1bQ01065 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pde1bQ01065 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Pde1bQ01065 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pde1bQ01065 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pde1bQ01065 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Pde1bQ01065 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Pde1bQ01065 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pde1bQ01065 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pde1bQ01065 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pde1bQ01065 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pde1bQ01065 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Pde1bQ01065 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pde1bQ01065 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pde1bQ01065 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pde1bQ01065 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Pde1bQ01065 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pde1bQ01065 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pde1bQ01065 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pde1bQ01065 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pde1bQ01065 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pde1bQ01065 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pde1bQ01065 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pde1bQ01065 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pde1bQ01065 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pde1bQ01065 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pde1bQ01065 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pde1bQ01065 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pde1bQ01065 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pde1bQ01065 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pde1bQ01065 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pde1bQ01065 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pde1bQ01065 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pde1bQ01065 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pde1bQ01065 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pde1bQ01065 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pde1bQ01065 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pde1bQ01065 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pde1bQ01065 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pde1bQ01065 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pde1bQ01065 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pde1bQ01065 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pde1bQ01065 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pde1bQ01065 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pde1bQ01065 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pde1bQ01065 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pde1bQ01065 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pde1bQ01065 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pde1bQ01065 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pde1bQ01065 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pde1bQ01065 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pde1bQ01065 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pde1bQ01065 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pde1bQ01065 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms