Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MDM2Q00987 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MDM2Q00987 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MDM2Q00987 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MDM2Q00987 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MDM2Q00987 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MDM2Q00987 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MDM2Q00987 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MDM2Q00987 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MDM2Q00987 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MDM2Q00987 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MDM2Q00987 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MDM2Q00987 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MDM2Q00987 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MDM2Q00987 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MDM2Q00987 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MDM2Q00987 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
MDM2Q00987 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MDM2Q00987 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MDM2Q00987 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MDM2Q00987 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MDM2Q00987 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MDM2Q00987 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MDM2Q00987 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
MDM2Q00987 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MDM2Q00987 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MDM2Q00987 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MDM2Q00987 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MDM2Q00987 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MDM2Q00987 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MDM2Q00987 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
MDM2Q00987 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
MDM2Q00987 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MDM2Q00987 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
MDM2Q00987 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MDM2Q00987 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MDM2Q00987 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MDM2Q00987 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MDM2Q00987 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MDM2Q00987 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
MDM2Q00987 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MDM2Q00987 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MDM2Q00987 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MDM2Q00987 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MDM2Q00987 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MDM2Q00987 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MDM2Q00987 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MDM2Q00987 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MDM2Q00987 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MDM2Q00987 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MDM2Q00987 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
MDM2Q00987 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MDM2Q00987 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MDM2Q00987 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MDM2Q00987 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MDM2Q00987 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MDM2Q00987 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MDM2Q00987 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MDM2Q00987 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MDM2Q00987 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MDM2Q00987 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MDM2Q00987 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MDM2Q00987 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MDM2Q00987 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MDM2Q00987 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MDM2Q00987 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MDM2Q00987 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MDM2Q00987 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MDM2Q00987 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MDM2Q00987 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MDM2Q00987 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MDM2Q00987 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MDM2Q00987 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MDM2Q00987 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MDM2Q00987 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MDM2Q00987 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MDM2Q00987 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MDM2Q00987 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MDM2Q00987 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MDM2Q00987 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MDM2Q00987 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MDM2Q00987 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MDM2Q00987 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MDM2Q00987 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MDM2Q00987 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MDM2Q00987 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
MDM2Q00987 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MDM2Q00987 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MDM2Q00987 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MDM2Q00987 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MDM2Q00987 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MDM2Q00987 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MDM2Q00987 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MDM2Q00987 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MDM2Q00987 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MDM2Q00987 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MDM2Q00987 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MDM2Q00987 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MDM2Q00987 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MDM2Q00987 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms