Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbp4Q00724 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbp4Q00724 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbp4Q00724 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbp4Q00724 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbp4Q00724 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbp4Q00724 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbp4Q00724 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbp4Q00724 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbp4Q00724 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbp4Q00724 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbp4Q00724 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbp4Q00724 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbp4Q00724 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbp4Q00724 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbp4Q00724 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbp4Q00724 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbp4Q00724 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbp4Q00724 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbp4Q00724 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbp4Q00724 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbp4Q00724 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbp4Q00724 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbp4Q00724 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbp4Q00724 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbp4Q00724 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbp4Q00724 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbp4Q00724 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbp4Q00724 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbp4Q00724 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbp4Q00724 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbp4Q00724 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbp4Q00724 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbp4Q00724 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbp4Q00724 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbp4Q00724 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbp4Q00724 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbp4Q00724 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbp4Q00724 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbp4Q00724 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbp4Q00724 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbp4Q00724 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbp4Q00724 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbp4Q00724 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbp4Q00724 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbp4Q00724 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbp4Q00724 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbp4Q00724 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbp4Q00724 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbp4Q00724 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbp4Q00724 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbp4Q00724 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbp4Q00724 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbp4Q00724 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbp4Q00724 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbp4Q00724 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbp4Q00724 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbp4Q00724 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbp4Q00724 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbp4Q00724 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbp4Q00724 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbp4Q00724 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbp4Q00724 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbp4Q00724 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbp4Q00724 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbp4Q00724 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbp4Q00724 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbp4Q00724 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbp4Q00724 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbp4Q00724 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbp4Q00724 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbp4Q00724 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbp4Q00724 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbp4Q00724 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbp4Q00724 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbp4Q00724 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbp4Q00724 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbp4Q00724 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbp4Q00724 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbp4Q00724 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbp4Q00724 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbp4Q00724 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbp4Q00724 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbp4Q00724 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbp4Q00724 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbp4Q00724 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbp4Q00724 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbp4Q00724 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbp4Q00724 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbp4Q00724 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbp4Q00724 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbp4Q00724 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbp4Q00724 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbp4Q00724 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbp4Q00724 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbp4Q00724 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbp4Q00724 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbp4Q00724 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbp4Q00724 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbp4Q00724 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms