Protein–RNA interactions for Protein: Q00286

Pou1f1, Pituitary-specific positive transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou1f1Q00286 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pou1f1Q00286 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pou1f1Q00286 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pou1f1Q00286 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pou1f1Q00286 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pou1f1Q00286 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pou1f1Q00286 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pou1f1Q00286 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pou1f1Q00286 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pou1f1Q00286 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pou1f1Q00286 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pou1f1Q00286 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pou1f1Q00286 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pou1f1Q00286 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pou1f1Q00286 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pou1f1Q00286 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pou1f1Q00286 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pou1f1Q00286 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pou1f1Q00286 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pou1f1Q00286 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Pou1f1Q00286 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Pou1f1Q00286 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pou1f1Q00286 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pou1f1Q00286 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Pou1f1Q00286 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Pou1f1Q00286 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pou1f1Q00286 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pou1f1Q00286 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pou1f1Q00286 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pou1f1Q00286 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pou1f1Q00286 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Pou1f1Q00286 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pou1f1Q00286 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pou1f1Q00286 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Pou1f1Q00286 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pou1f1Q00286 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pou1f1Q00286 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pou1f1Q00286 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pou1f1Q00286 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pou1f1Q00286 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pou1f1Q00286 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pou1f1Q00286 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pou1f1Q00286 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pou1f1Q00286 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pou1f1Q00286 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Pou1f1Q00286 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pou1f1Q00286 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pou1f1Q00286 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pou1f1Q00286 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pou1f1Q00286 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pou1f1Q00286 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pou1f1Q00286 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pou1f1Q00286 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pou1f1Q00286 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pou1f1Q00286 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pou1f1Q00286 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pou1f1Q00286 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pou1f1Q00286 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Pou1f1Q00286 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pou1f1Q00286 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pou1f1Q00286 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pou1f1Q00286 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pou1f1Q00286 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pou1f1Q00286 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pou1f1Q00286 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pou1f1Q00286 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pou1f1Q00286 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pou1f1Q00286 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pou1f1Q00286 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pou1f1Q00286 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pou1f1Q00286 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pou1f1Q00286 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pou1f1Q00286 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pou1f1Q00286 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pou1f1Q00286 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pou1f1Q00286 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pou1f1Q00286 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pou1f1Q00286 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pou1f1Q00286 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pou1f1Q00286 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pou1f1Q00286 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pou1f1Q00286 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pou1f1Q00286 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pou1f1Q00286 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pou1f1Q00286 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pou1f1Q00286 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pou1f1Q00286 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pou1f1Q00286 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pou1f1Q00286 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Pou1f1Q00286 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pou1f1Q00286 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pou1f1Q00286 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pou1f1Q00286 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pou1f1Q00286 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pou1f1Q00286 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pou1f1Q00286 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pou1f1Q00286 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pou1f1Q00286 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pou1f1Q00286 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pou1f1Q00286 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms