Protein–RNA interactions for Protein: Q00262

Stx2, Syntaxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx2Q00262 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Stx2Q00262 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Stx2Q00262 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Stx2Q00262 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Stx2Q00262 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Stx2Q00262 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Stx2Q00262 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Stx2Q00262 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Stx2Q00262 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Stx2Q00262 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Stx2Q00262 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Stx2Q00262 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Stx2Q00262 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Stx2Q00262 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Stx2Q00262 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Stx2Q00262 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Stx2Q00262 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Stx2Q00262 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Stx2Q00262 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Stx2Q00262 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Stx2Q00262 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Stx2Q00262 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Stx2Q00262 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Stx2Q00262 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Stx2Q00262 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Stx2Q00262 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Stx2Q00262 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Stx2Q00262 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Stx2Q00262 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Stx2Q00262 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Stx2Q00262 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Stx2Q00262 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Stx2Q00262 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Stx2Q00262 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Stx2Q00262 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Stx2Q00262 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Stx2Q00262 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Stx2Q00262 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Stx2Q00262 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Stx2Q00262 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Stx2Q00262 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Stx2Q00262 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Stx2Q00262 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Stx2Q00262 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Stx2Q00262 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Stx2Q00262 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Stx2Q00262 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Stx2Q00262 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Stx2Q00262 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Stx2Q00262 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Stx2Q00262 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Stx2Q00262 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Stx2Q00262 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Stx2Q00262 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Stx2Q00262 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Stx2Q00262 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Stx2Q00262 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Stx2Q00262 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Stx2Q00262 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Stx2Q00262 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Stx2Q00262 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Stx2Q00262 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Stx2Q00262 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Stx2Q00262 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Stx2Q00262 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Stx2Q00262 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Stx2Q00262 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Stx2Q00262 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Stx2Q00262 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Stx2Q00262 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Stx2Q00262 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Stx2Q00262 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Stx2Q00262 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Stx2Q00262 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Stx2Q00262 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Stx2Q00262 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Stx2Q00262 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Stx2Q00262 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Stx2Q00262 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Stx2Q00262 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Stx2Q00262 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Stx2Q00262 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Stx2Q00262 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Stx2Q00262 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Stx2Q00262 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Stx2Q00262 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Stx2Q00262 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Stx2Q00262 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Stx2Q00262 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Stx2Q00262 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Stx2Q00262 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Stx2Q00262 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Stx2Q00262 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Stx2Q00262 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Stx2Q00262 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Stx2Q00262 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Stx2Q00262 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Stx2Q00262 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Stx2Q00262 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Stx2Q00262 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms