Protein–RNA interactions for Protein: P97334

Nkx2-3, Homeobox protein Nkx-2.3, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-3P97334 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nkx2-3P97334 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Nkx2-3P97334 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nkx2-3P97334 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nkx2-3P97334 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nkx2-3P97334 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nkx2-3P97334 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nkx2-3P97334 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nkx2-3P97334 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nkx2-3P97334 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Nkx2-3P97334 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nkx2-3P97334 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nkx2-3P97334 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nkx2-3P97334 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nkx2-3P97334 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nkx2-3P97334 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nkx2-3P97334 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nkx2-3P97334 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nkx2-3P97334 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Nkx2-3P97334 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Nkx2-3P97334 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Nkx2-3P97334 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nkx2-3P97334 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Nkx2-3P97334 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nkx2-3P97334 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nkx2-3P97334 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nkx2-3P97334 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nkx2-3P97334 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Nkx2-3P97334 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nkx2-3P97334 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nkx2-3P97334 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nkx2-3P97334 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nkx2-3P97334 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nkx2-3P97334 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nkx2-3P97334 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nkx2-3P97334 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nkx2-3P97334 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nkx2-3P97334 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nkx2-3P97334 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nkx2-3P97334 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nkx2-3P97334 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nkx2-3P97334 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nkx2-3P97334 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nkx2-3P97334 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Nkx2-3P97334 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Nkx2-3P97334 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nkx2-3P97334 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nkx2-3P97334 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nkx2-3P97334 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nkx2-3P97334 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nkx2-3P97334 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nkx2-3P97334 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Nkx2-3P97334 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nkx2-3P97334 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nkx2-3P97334 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nkx2-3P97334 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nkx2-3P97334 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nkx2-3P97334 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nkx2-3P97334 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nkx2-3P97334 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nkx2-3P97334 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nkx2-3P97334 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nkx2-3P97334 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nkx2-3P97334 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nkx2-3P97334 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nkx2-3P97334 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nkx2-3P97334 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nkx2-3P97334 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Nkx2-3P97334 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nkx2-3P97334 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nkx2-3P97334 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nkx2-3P97334 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nkx2-3P97334 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nkx2-3P97334 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nkx2-3P97334 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nkx2-3P97334 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nkx2-3P97334 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nkx2-3P97334 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nkx2-3P97334 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nkx2-3P97334 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nkx2-3P97334 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nkx2-3P97334 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nkx2-3P97334 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nkx2-3P97334 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nkx2-3P97334 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Nkx2-3P97334 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nkx2-3P97334 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nkx2-3P97334 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nkx2-3P97334 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nkx2-3P97334 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nkx2-3P97334 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nkx2-3P97334 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nkx2-3P97334 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nkx2-3P97334 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nkx2-3P97334 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nkx2-3P97334 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nkx2-3P97334 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nkx2-3P97334 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nkx2-3P97334 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nkx2-3P97334 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms