Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
H3f3aP84244 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
H3f3aP84244 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
H3f3aP84244 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
H3f3aP84244 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
H3f3aP84244 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
H3f3aP84244 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
H3f3aP84244 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
H3f3aP84244 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
H3f3aP84244 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
H3f3aP84244 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
H3f3aP84244 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
H3f3aP84244 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
H3f3aP84244 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
H3f3aP84244 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
H3f3aP84244 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
H3f3aP84244 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
H3f3aP84244 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
H3f3aP84244 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
H3f3aP84244 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
H3f3aP84244 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
H3f3aP84244 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
H3f3aP84244 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
H3f3aP84244 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
H3f3aP84244 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
H3f3aP84244 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
H3f3aP84244 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
H3f3aP84244 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
H3f3aP84244 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
H3f3aP84244 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
H3f3aP84244 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
H3f3aP84244 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
H3f3aP84244 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
H3f3aP84244 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
H3f3aP84244 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
H3f3aP84244 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
H3f3aP84244 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
H3f3aP84244 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
H3f3aP84244 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
H3f3aP84244 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
H3f3aP84244 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
H3f3aP84244 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
H3f3aP84244 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
H3f3aP84244 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
H3f3aP84244 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
H3f3aP84244 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
H3f3aP84244 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
H3f3aP84244 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
H3f3aP84244 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
H3f3aP84244 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
H3f3aP84244 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
H3f3aP84244 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
H3f3aP84244 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
H3f3aP84244 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
H3f3aP84244 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
H3f3aP84244 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
H3f3aP84244 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
H3f3aP84244 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
H3f3aP84244 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H3f3aP84244 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H3f3aP84244 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H3f3aP84244 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H3f3aP84244 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H3f3aP84244 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H3f3aP84244 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
H3f3aP84244 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H3f3aP84244 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
H3f3aP84244 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H3f3aP84244 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H3f3aP84244 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H3f3aP84244 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
H3f3aP84244 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H3f3aP84244 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H3f3aP84244 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H3f3aP84244 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H3f3aP84244 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.29
H3f3aP84244 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
H3f3aP84244 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
H3f3aP84244 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
H3f3aP84244 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
H3f3aP84244 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
H3f3aP84244 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
H3f3aP84244 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
H3f3aP84244 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
H3f3aP84244 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
H3f3aP84244 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
H3f3aP84244 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
H3f3aP84244 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
H3f3aP84244 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
H3f3aP84244 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
H3f3aP84244 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
H3f3aP84244 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
H3f3aP84244 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
H3f3aP84244 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
H3f3aP84244 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
H3f3aP84244 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
H3f3aP84244 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
H3f3aP84244 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
H3f3aP84244 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
H3f3aP84244 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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