Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp9xP70398 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp9xP70398 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp9xP70398 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp9xP70398 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp9xP70398 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp9xP70398 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp9xP70398 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp9xP70398 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp9xP70398 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp9xP70398 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp9xP70398 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp9xP70398 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp9xP70398 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp9xP70398 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp9xP70398 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp9xP70398 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp9xP70398 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp9xP70398 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp9xP70398 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp9xP70398 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp9xP70398 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp9xP70398 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp9xP70398 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp9xP70398 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp9xP70398 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp9xP70398 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp9xP70398 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp9xP70398 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp9xP70398 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp9xP70398 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp9xP70398 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp9xP70398 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp9xP70398 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp9xP70398 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp9xP70398 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp9xP70398 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp9xP70398 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp9xP70398 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp9xP70398 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp9xP70398 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp9xP70398 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp9xP70398 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp9xP70398 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp9xP70398 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp9xP70398 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp9xP70398 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp9xP70398 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp9xP70398 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp9xP70398 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp9xP70398 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp9xP70398 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp9xP70398 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp9xP70398 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp9xP70398 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp9xP70398 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp9xP70398 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp9xP70398 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp9xP70398 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp9xP70398 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp9xP70398 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp9xP70398 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp9xP70398 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp9xP70398 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp9xP70398 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp9xP70398 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp9xP70398 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp9xP70398 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp9xP70398 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp9xP70398 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp9xP70398 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp9xP70398 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp9xP70398 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp9xP70398 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp9xP70398 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp9xP70398 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp9xP70398 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp9xP70398 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp9xP70398 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp9xP70398 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp9xP70398 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp9xP70398 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp9xP70398 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp9xP70398 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp9xP70398 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp9xP70398 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp9xP70398 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp9xP70398 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp9xP70398 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp9xP70398 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp9xP70398 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp9xP70398 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp9xP70398 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp9xP70398 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp9xP70398 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp9xP70398 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp9xP70398 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp9xP70398 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp9xP70398 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp9xP70398 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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