Protein–RNA interactions for Protein: P70314

Pitx1, Pituitary homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx1P70314 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pitx1P70314 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pitx1P70314 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pitx1P70314 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pitx1P70314 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pitx1P70314 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pitx1P70314 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pitx1P70314 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pitx1P70314 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pitx1P70314 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pitx1P70314 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Pitx1P70314 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pitx1P70314 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pitx1P70314 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pitx1P70314 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pitx1P70314 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pitx1P70314 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pitx1P70314 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pitx1P70314 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pitx1P70314 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pitx1P70314 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Pitx1P70314 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pitx1P70314 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pitx1P70314 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Pitx1P70314 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pitx1P70314 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pitx1P70314 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pitx1P70314 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pitx1P70314 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pitx1P70314 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pitx1P70314 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pitx1P70314 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pitx1P70314 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Pitx1P70314 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pitx1P70314 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pitx1P70314 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pitx1P70314 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pitx1P70314 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pitx1P70314 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pitx1P70314 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pitx1P70314 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pitx1P70314 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pitx1P70314 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pitx1P70314 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pitx1P70314 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pitx1P70314 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pitx1P70314 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pitx1P70314 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pitx1P70314 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pitx1P70314 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pitx1P70314 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pitx1P70314 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pitx1P70314 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Pitx1P70314 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Pitx1P70314 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Pitx1P70314 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Pitx1P70314 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pitx1P70314 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pitx1P70314 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pitx1P70314 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pitx1P70314 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pitx1P70314 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pitx1P70314 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pitx1P70314 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pitx1P70314 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pitx1P70314 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pitx1P70314 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pitx1P70314 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pitx1P70314 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pitx1P70314 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pitx1P70314 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pitx1P70314 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pitx1P70314 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pitx1P70314 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pitx1P70314 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pitx1P70314 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pitx1P70314 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pitx1P70314 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pitx1P70314 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pitx1P70314 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pitx1P70314 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pitx1P70314 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pitx1P70314 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pitx1P70314 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pitx1P70314 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pitx1P70314 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Pitx1P70314 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pitx1P70314 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pitx1P70314 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pitx1P70314 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Pitx1P70314 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pitx1P70314 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pitx1P70314 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pitx1P70314 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pitx1P70314 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pitx1P70314 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pitx1P70314 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pitx1P70314 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pitx1P70314 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Pitx1P70314 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms