Protein–RNA interactions for Protein: P70193

Lrig1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig1P70193 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrig1P70193 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrig1P70193 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrig1P70193 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrig1P70193 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrig1P70193 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrig1P70193 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrig1P70193 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrig1P70193 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrig1P70193 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrig1P70193 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrig1P70193 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrig1P70193 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrig1P70193 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrig1P70193 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrig1P70193 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrig1P70193 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrig1P70193 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrig1P70193 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrig1P70193 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrig1P70193 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrig1P70193 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrig1P70193 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrig1P70193 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrig1P70193 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrig1P70193 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrig1P70193 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrig1P70193 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lrig1P70193 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lrig1P70193 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lrig1P70193 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lrig1P70193 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lrig1P70193 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lrig1P70193 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lrig1P70193 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrig1P70193 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrig1P70193 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrig1P70193 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrig1P70193 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrig1P70193 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrig1P70193 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrig1P70193 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrig1P70193 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrig1P70193 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrig1P70193 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrig1P70193 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrig1P70193 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrig1P70193 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrig1P70193 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrig1P70193 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrig1P70193 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrig1P70193 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrig1P70193 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrig1P70193 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrig1P70193 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrig1P70193 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrig1P70193 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrig1P70193 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrig1P70193 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrig1P70193 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrig1P70193 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrig1P70193 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrig1P70193 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrig1P70193 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrig1P70193 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrig1P70193 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrig1P70193 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrig1P70193 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrig1P70193 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrig1P70193 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrig1P70193 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrig1P70193 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrig1P70193 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrig1P70193 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrig1P70193 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrig1P70193 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrig1P70193 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrig1P70193 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrig1P70193 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrig1P70193 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrig1P70193 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrig1P70193 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrig1P70193 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrig1P70193 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrig1P70193 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrig1P70193 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrig1P70193 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrig1P70193 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrig1P70193 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrig1P70193 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrig1P70193 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrig1P70193 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrig1P70193 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrig1P70193 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrig1P70193 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrig1P70193 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrig1P70193 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrig1P70193 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrig1P70193 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrig1P70193 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms