Protein–RNA interactions for Protein: P70191

Traf5, TNF receptor-associated factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf5P70191 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Traf5P70191 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Traf5P70191 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Traf5P70191 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Traf5P70191 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Traf5P70191 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Traf5P70191 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Traf5P70191 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Traf5P70191 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Traf5P70191 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Traf5P70191 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Traf5P70191 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Traf5P70191 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Traf5P70191 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Traf5P70191 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Traf5P70191 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Traf5P70191 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Traf5P70191 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Traf5P70191 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Traf5P70191 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Traf5P70191 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Traf5P70191 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Traf5P70191 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Traf5P70191 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Traf5P70191 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Traf5P70191 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Traf5P70191 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Traf5P70191 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Traf5P70191 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Traf5P70191 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Traf5P70191 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Traf5P70191 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Traf5P70191 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Traf5P70191 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Traf5P70191 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Traf5P70191 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Traf5P70191 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Traf5P70191 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Traf5P70191 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Traf5P70191 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Traf5P70191 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Traf5P70191 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Traf5P70191 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Traf5P70191 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Traf5P70191 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Traf5P70191 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Traf5P70191 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Traf5P70191 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Traf5P70191 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Traf5P70191 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Traf5P70191 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Traf5P70191 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Traf5P70191 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Traf5P70191 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Traf5P70191 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Traf5P70191 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Traf5P70191 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Traf5P70191 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Traf5P70191 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Traf5P70191 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Traf5P70191 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Traf5P70191 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Traf5P70191 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Traf5P70191 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Traf5P70191 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Traf5P70191 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Traf5P70191 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Traf5P70191 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Traf5P70191 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Traf5P70191 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Traf5P70191 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Traf5P70191 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Traf5P70191 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Traf5P70191 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Traf5P70191 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Traf5P70191 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Traf5P70191 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Traf5P70191 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Traf5P70191 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Traf5P70191 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Traf5P70191 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Traf5P70191 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Traf5P70191 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Traf5P70191 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Traf5P70191 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Traf5P70191 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Traf5P70191 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Traf5P70191 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Traf5P70191 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Traf5P70191 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Traf5P70191 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Traf5P70191 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Traf5P70191 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Traf5P70191 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Traf5P70191 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Traf5P70191 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Traf5P70191 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Traf5P70191 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Traf5P70191 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Traf5P70191 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms