Protein–RNA interactions for Protein: P63089

Ptn, Pleiotrophin, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtnP63089 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PtnP63089 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PtnP63089 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PtnP63089 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PtnP63089 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PtnP63089 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PtnP63089 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PtnP63089 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PtnP63089 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PtnP63089 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PtnP63089 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PtnP63089 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PtnP63089 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PtnP63089 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PtnP63089 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PtnP63089 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PtnP63089 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtnP63089 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtnP63089 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtnP63089 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtnP63089 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtnP63089 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtnP63089 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtnP63089 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtnP63089 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtnP63089 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtnP63089 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
PtnP63089 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
PtnP63089 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
PtnP63089 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
PtnP63089 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PtnP63089 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PtnP63089 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PtnP63089 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PtnP63089 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PtnP63089 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PtnP63089 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PtnP63089 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PtnP63089 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PtnP63089 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PtnP63089 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PtnP63089 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PtnP63089 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtnP63089 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtnP63089 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtnP63089 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtnP63089 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PtnP63089 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtnP63089 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtnP63089 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtnP63089 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtnP63089 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtnP63089 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtnP63089 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtnP63089 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtnP63089 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtnP63089 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PtnP63089 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtnP63089 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtnP63089 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtnP63089 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PtnP63089 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PtnP63089 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PtnP63089 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PtnP63089 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PtnP63089 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PtnP63089 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PtnP63089 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PtnP63089 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PtnP63089 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PtnP63089 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PtnP63089 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PtnP63089 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PtnP63089 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PtnP63089 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PtnP63089 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PtnP63089 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PtnP63089 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PtnP63089 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PtnP63089 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PtnP63089 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PtnP63089 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PtnP63089 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PtnP63089 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PtnP63089 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PtnP63089 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PtnP63089 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PtnP63089 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PtnP63089 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PtnP63089 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PtnP63089 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PtnP63089 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PtnP63089 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PtnP63089 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PtnP63089 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PtnP63089 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PtnP63089 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PtnP63089 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PtnP63089 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PtnP63089 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms