Protein–RNA interactions for Protein: P63080

Gabrb3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrb3P63080 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gabrb3P63080 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gabrb3P63080 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gabrb3P63080 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gabrb3P63080 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gabrb3P63080 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gabrb3P63080 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gabrb3P63080 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gabrb3P63080 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gabrb3P63080 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gabrb3P63080 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gabrb3P63080 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gabrb3P63080 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gabrb3P63080 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gabrb3P63080 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gabrb3P63080 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gabrb3P63080 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Gabrb3P63080 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gabrb3P63080 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Gabrb3P63080 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Gabrb3P63080 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gabrb3P63080 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gabrb3P63080 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gabrb3P63080 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Gabrb3P63080 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gabrb3P63080 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gabrb3P63080 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gabrb3P63080 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gabrb3P63080 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gabrb3P63080 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gabrb3P63080 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gabrb3P63080 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gabrb3P63080 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gabrb3P63080 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gabrb3P63080 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gabrb3P63080 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gabrb3P63080 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gabrb3P63080 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gabrb3P63080 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gabrb3P63080 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gabrb3P63080 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gabrb3P63080 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gabrb3P63080 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gabrb3P63080 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gabrb3P63080 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gabrb3P63080 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Gabrb3P63080 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gabrb3P63080 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gabrb3P63080 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gabrb3P63080 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gabrb3P63080 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gabrb3P63080 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gabrb3P63080 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gabrb3P63080 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gabrb3P63080 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gabrb3P63080 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gabrb3P63080 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gabrb3P63080 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gabrb3P63080 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gabrb3P63080 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gabrb3P63080 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gabrb3P63080 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gabrb3P63080 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gabrb3P63080 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Gabrb3P63080 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gabrb3P63080 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gabrb3P63080 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gabrb3P63080 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gabrb3P63080 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gabrb3P63080 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gabrb3P63080 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gabrb3P63080 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gabrb3P63080 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gabrb3P63080 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gabrb3P63080 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gabrb3P63080 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gabrb3P63080 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gabrb3P63080 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gabrb3P63080 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gabrb3P63080 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gabrb3P63080 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gabrb3P63080 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gabrb3P63080 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gabrb3P63080 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gabrb3P63080 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gabrb3P63080 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gabrb3P63080 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gabrb3P63080 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gabrb3P63080 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gabrb3P63080 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gabrb3P63080 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gabrb3P63080 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gabrb3P63080 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gabrb3P63080 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gabrb3P63080 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gabrb3P63080 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gabrb3P63080 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gabrb3P63080 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gabrb3P63080 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Gabrb3P63080 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms