Protein–RNA interactions for Protein: P62908

Rps3, 40S ribosomal protein S3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3P62908 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rps3P62908 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rps3P62908 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rps3P62908 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rps3P62908 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rps3P62908 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rps3P62908 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rps3P62908 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rps3P62908 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rps3P62908 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rps3P62908 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rps3P62908 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rps3P62908 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rps3P62908 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rps3P62908 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rps3P62908 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rps3P62908 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rps3P62908 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rps3P62908 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rps3P62908 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rps3P62908 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rps3P62908 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rps3P62908 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rps3P62908 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rps3P62908 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rps3P62908 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rps3P62908 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rps3P62908 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rps3P62908 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rps3P62908 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rps3P62908 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rps3P62908 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rps3P62908 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rps3P62908 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rps3P62908 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rps3P62908 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rps3P62908 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rps3P62908 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rps3P62908 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rps3P62908 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rps3P62908 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rps3P62908 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rps3P62908 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rps3P62908 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rps3P62908 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rps3P62908 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rps3P62908 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rps3P62908 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rps3P62908 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rps3P62908 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rps3P62908 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rps3P62908 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rps3P62908 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rps3P62908 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rps3P62908 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rps3P62908 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rps3P62908 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rps3P62908 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rps3P62908 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rps3P62908 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rps3P62908 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rps3P62908 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rps3P62908 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rps3P62908 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rps3P62908 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rps3P62908 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rps3P62908 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Rps3P62908 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rps3P62908 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Rps3P62908 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rps3P62908 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rps3P62908 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rps3P62908 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rps3P62908 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rps3P62908 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rps3P62908 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rps3P62908 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rps3P62908 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rps3P62908 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rps3P62908 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rps3P62908 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rps3P62908 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rps3P62908 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rps3P62908 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Rps3P62908 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rps3P62908 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rps3P62908 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rps3P62908 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rps3P62908 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rps3P62908 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rps3P62908 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Rps3P62908 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rps3P62908 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Rps3P62908 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rps3P62908 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rps3P62908 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rps3P62908 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rps3P62908 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rps3P62908 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rps3P62908 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms