Protein–RNA interactions for Protein: P62307

Snrpf, Small nuclear ribonucleoprotein F, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpfP62307 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SnrpfP62307 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SnrpfP62307 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SnrpfP62307 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SnrpfP62307 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SnrpfP62307 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SnrpfP62307 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SnrpfP62307 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SnrpfP62307 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SnrpfP62307 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SnrpfP62307 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SnrpfP62307 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SnrpfP62307 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SnrpfP62307 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SnrpfP62307 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SnrpfP62307 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SnrpfP62307 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SnrpfP62307 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SnrpfP62307 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SnrpfP62307 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SnrpfP62307 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SnrpfP62307 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SnrpfP62307 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SnrpfP62307 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SnrpfP62307 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SnrpfP62307 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SnrpfP62307 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SnrpfP62307 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SnrpfP62307 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SnrpfP62307 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SnrpfP62307 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SnrpfP62307 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SnrpfP62307 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SnrpfP62307 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SnrpfP62307 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SnrpfP62307 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SnrpfP62307 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SnrpfP62307 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SnrpfP62307 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SnrpfP62307 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SnrpfP62307 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SnrpfP62307 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SnrpfP62307 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SnrpfP62307 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SnrpfP62307 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SnrpfP62307 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SnrpfP62307 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SnrpfP62307 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SnrpfP62307 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SnrpfP62307 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SnrpfP62307 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SnrpfP62307 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SnrpfP62307 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SnrpfP62307 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SnrpfP62307 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SnrpfP62307 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SnrpfP62307 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SnrpfP62307 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SnrpfP62307 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SnrpfP62307 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SnrpfP62307 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SnrpfP62307 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SnrpfP62307 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SnrpfP62307 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SnrpfP62307 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SnrpfP62307 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SnrpfP62307 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SnrpfP62307 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SnrpfP62307 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SnrpfP62307 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SnrpfP62307 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SnrpfP62307 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SnrpfP62307 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SnrpfP62307 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SnrpfP62307 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SnrpfP62307 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SnrpfP62307 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SnrpfP62307 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SnrpfP62307 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SnrpfP62307 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SnrpfP62307 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SnrpfP62307 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SnrpfP62307 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SnrpfP62307 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SnrpfP62307 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SnrpfP62307 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SnrpfP62307 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SnrpfP62307 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SnrpfP62307 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SnrpfP62307 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SnrpfP62307 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SnrpfP62307 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SnrpfP62307 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SnrpfP62307 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SnrpfP62307 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SnrpfP62307 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SnrpfP62307 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SnrpfP62307 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SnrpfP62307 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SnrpfP62307 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms