Protein–RNA interactions for Protein: P61924

Copz1, Coatomer subunit zeta-1, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copz1P61924 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Copz1P61924 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Copz1P61924 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Copz1P61924 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Copz1P61924 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Copz1P61924 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Copz1P61924 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Copz1P61924 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Copz1P61924 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Copz1P61924 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Copz1P61924 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Copz1P61924 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Copz1P61924 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Copz1P61924 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Copz1P61924 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Copz1P61924 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Copz1P61924 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Copz1P61924 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Copz1P61924 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Copz1P61924 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Copz1P61924 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Copz1P61924 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Copz1P61924 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Copz1P61924 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Copz1P61924 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Copz1P61924 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Copz1P61924 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Copz1P61924 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Copz1P61924 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Copz1P61924 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Copz1P61924 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Copz1P61924 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Copz1P61924 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Copz1P61924 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Copz1P61924 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Copz1P61924 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Copz1P61924 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Copz1P61924 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Copz1P61924 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Copz1P61924 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Copz1P61924 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Copz1P61924 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Copz1P61924 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Copz1P61924 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Copz1P61924 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Copz1P61924 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Copz1P61924 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Copz1P61924 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Copz1P61924 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Copz1P61924 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Copz1P61924 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Copz1P61924 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Copz1P61924 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Copz1P61924 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Copz1P61924 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Copz1P61924 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Copz1P61924 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Copz1P61924 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Copz1P61924 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Copz1P61924 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Copz1P61924 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Copz1P61924 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Copz1P61924 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Copz1P61924 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Copz1P61924 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Copz1P61924 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Copz1P61924 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Copz1P61924 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Copz1P61924 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Copz1P61924 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Copz1P61924 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Copz1P61924 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Copz1P61924 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Copz1P61924 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Copz1P61924 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Copz1P61924 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Copz1P61924 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Copz1P61924 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Copz1P61924 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Copz1P61924 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Copz1P61924 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Copz1P61924 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Copz1P61924 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Copz1P61924 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Copz1P61924 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Copz1P61924 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Copz1P61924 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Copz1P61924 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Copz1P61924 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Copz1P61924 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Copz1P61924 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Copz1P61924 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Copz1P61924 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Copz1P61924 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Copz1P61924 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Copz1P61924 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Copz1P61924 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Copz1P61924 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Copz1P61924 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Copz1P61924 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms