Protein–RNA interactions for Protein: P61622

Itga11, Integrin alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga11P61622 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Itga11P61622 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Itga11P61622 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Itga11P61622 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Itga11P61622 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Itga11P61622 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Itga11P61622 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Itga11P61622 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Itga11P61622 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Itga11P61622 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Itga11P61622 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Itga11P61622 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Itga11P61622 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Itga11P61622 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Itga11P61622 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Itga11P61622 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Itga11P61622 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Itga11P61622 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Itga11P61622 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Itga11P61622 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Itga11P61622 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Itga11P61622 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Itga11P61622 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Itga11P61622 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Itga11P61622 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Itga11P61622 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Itga11P61622 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Itga11P61622 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Itga11P61622 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Itga11P61622 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Itga11P61622 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Itga11P61622 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Itga11P61622 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Itga11P61622 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Itga11P61622 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Itga11P61622 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Itga11P61622 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Itga11P61622 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Itga11P61622 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Itga11P61622 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Itga11P61622 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Itga11P61622 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Itga11P61622 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Itga11P61622 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Itga11P61622 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Itga11P61622 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Itga11P61622 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Itga11P61622 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Itga11P61622 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Itga11P61622 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Itga11P61622 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Itga11P61622 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Itga11P61622 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Itga11P61622 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Itga11P61622 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Itga11P61622 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Itga11P61622 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Itga11P61622 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Itga11P61622 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Itga11P61622 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Itga11P61622 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Itga11P61622 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Itga11P61622 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Itga11P61622 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Itga11P61622 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Itga11P61622 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Itga11P61622 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Itga11P61622 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Itga11P61622 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Itga11P61622 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Itga11P61622 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Itga11P61622 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Itga11P61622 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Itga11P61622 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Itga11P61622 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Itga11P61622 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Itga11P61622 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Itga11P61622 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Itga11P61622 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Itga11P61622 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Itga11P61622 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Itga11P61622 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Itga11P61622 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Itga11P61622 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Itga11P61622 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Itga11P61622 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Itga11P61622 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Itga11P61622 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Itga11P61622 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Itga11P61622 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Itga11P61622 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Itga11P61622 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Itga11P61622 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Itga11P61622 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Itga11P61622 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Itga11P61622 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Itga11P61622 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Itga11P61622 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Itga11P61622 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Itga11P61622 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms