Protein–RNA interactions for Protein: P61568

ERVK11-1, Putative endogenous retrovirus group K member 11-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK11-1P61568 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK11-1P61568 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK11-1P61568 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK11-1P61568 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK11-1P61568 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK11-1P61568 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK11-1P61568 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK11-1P61568 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK11-1P61568 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK11-1P61568 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK11-1P61568 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK11-1P61568 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK11-1P61568 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK11-1P61568 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK11-1P61568 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK11-1P61568 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK11-1P61568 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK11-1P61568 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK11-1P61568 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK11-1P61568 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK11-1P61568 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK11-1P61568 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK11-1P61568 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK11-1P61568 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK11-1P61568 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK11-1P61568 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK11-1P61568 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK11-1P61568 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK11-1P61568 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK11-1P61568 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK11-1P61568 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK11-1P61568 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK11-1P61568 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK11-1P61568 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK11-1P61568 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK11-1P61568 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK11-1P61568 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ERVK11-1P61568 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ERVK11-1P61568 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ERVK11-1P61568 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ERVK11-1P61568 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVK11-1P61568 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVK11-1P61568 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVK11-1P61568 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVK11-1P61568 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVK11-1P61568 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVK11-1P61568 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVK11-1P61568 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVK11-1P61568 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVK11-1P61568 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVK11-1P61568 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVK11-1P61568 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVK11-1P61568 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVK11-1P61568 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVK11-1P61568 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVK11-1P61568 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVK11-1P61568 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVK11-1P61568 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVK11-1P61568 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVK11-1P61568 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVK11-1P61568 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVK11-1P61568 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVK11-1P61568 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVK11-1P61568 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVK11-1P61568 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVK11-1P61568 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVK11-1P61568 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVK11-1P61568 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVK11-1P61568 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVK11-1P61568 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVK11-1P61568 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVK11-1P61568 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVK11-1P61568 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVK11-1P61568 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVK11-1P61568 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVK11-1P61568 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVK11-1P61568 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVK11-1P61568 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVK11-1P61568 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVK11-1P61568 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVK11-1P61568 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVK11-1P61568 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVK11-1P61568 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVK11-1P61568 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVK11-1P61568 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVK11-1P61568 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVK11-1P61568 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVK11-1P61568 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVK11-1P61568 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVK11-1P61568 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVK11-1P61568 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVK11-1P61568 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVK11-1P61568 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVK11-1P61568 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVK11-1P61568 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVK11-1P61568 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVK11-1P61568 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVK11-1P61568 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVK11-1P61568 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVK11-1P61568 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms